应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 求助:VASP进行分子动力学模拟后的对关联函数用什么办法能可视化?
51/1返回列表
查看: 1636  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

xiong54wei

木虫 (正式写手)

[交流] 求助:VASP进行分子动力学模拟后的对关联函数用什么办法能可视化?

求助:VASP进行分子动力学模拟后的对关联函数用什么办法能可视化或者如何作图?以下是我用MD模拟后PCDAT文件的结果
[...@node11 l-Nb]$ less PCDAT
   1  16   1   0  0.1977032E+02  0.2850000E+04
  CAR
MD in NTV ensemble                     
   0   0   0
   1  10
256 256 256
256
  0.1000000E-09
  0.6250000E-11
300
  0.1500000E-14  0.6813620E-09  0.6813620E-09  0.6813620E-09
  0.2838230E+04  0.2838231E+04
  0.000
  0.000
  0.000
  0.000
  0.000
........
1.542
  1.825
  1.558
  1.223
  0.846
.......
不明白这些数字是什么意思?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
到了金虫，再升一级就难了。。。
1楼 2008-10-04 22:01:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spur

金虫 (正式写手)
从来没处理过PCDAT，这个是干啥的？
赞一下 回复此楼
4楼2009-04-09 21:38:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

limaojlu

金虫 (正式写手)
★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):谢谢 4-9 19:41
你先前有个设置设定了 对关联考虑的长度，默认是16A，如果你设定是10的话，那你再将256个对关联的取值点，等距离对应，也就是每个点间隔10/256，这样得到距离R的数值。我是这样处理的，不知道对不对啊。
赞一下(10人) 回复此楼
2楼2009-04-09 17:48:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
★
zdhlover(金币+1,VIP+0):谢谢 4-11 00:58
一般都是自己编程处理
赞一下(10人) 回复此楼
3楼2009-04-09 19:53:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
★
zdhlover(金币+1,VIP+0):xiexie 4-11 00:58
引用回帖:
Originally posted by spur at 2009-4-9 21:38:
从来没处理过PCDAT，这个是干啥的？

就是对关联函数，一般都是做MD的弄它  
赞一下(10人) 回复此楼
5楼2009-04-09 21:40:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 5/250 2026-11-01 21:45 by xzcv0Tehd8lQ
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 8/400 2026-11-01 21:35 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 17/850 2026-11-01 21:26 by xzcv0Tehd8lQ
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 16/800 2026-11-01 21:19 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 20:03 by xzcv0Tehd8lQ
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 19:50 by xzcv0Tehd8lQ
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-01 16:58 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 15/750 2026-11-01 16:52 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 16:48 by BCdvBAEpt3zm
[基金申请] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 22/1100 2026-11-01 16:35 by BCdvBAEpt3zm
[基金申请] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 9/450 2026-11-01 14:55 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 14:37 by BCdvBAEpt3zm
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 3/150 2026-11-01 12:53 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 5/250 2026-11-01 12:51 by BCdvBAEpt3zm
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 11/550 2026-11-01 12:24 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 18/900 2026-11-01 12:11 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 11:14 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 9/450 2026-11-01 10:53 by BCdvBAEpt3zm
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-01 03:59 by YXM1FDCSE8Bn
[考博] 申博求助 20+3 Katrinae 2026-10-26 4/200 2026-10-27 09:56 by 北京莱茵编辑
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭