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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请问活化能计算中，反应物的能量该怎么算
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阿扑西林

铜虫 (初入文坛)

[交流] 请问活化能计算中，反应物的能量该怎么算

比如一个A+B——C+D的取代反应，中间经历了TS的过渡态，我想计算这个反应的活化能，就分别把A，B和TS的能量算出来（Sum of electronic and zero-point Energies），然后用TS的能量减去A和B的。
但是算得的值是负数。请问我的问题出在哪里？是不是反应物的能量不能将两个分子分开算？
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1楼 2008-10-02 17:06:32
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hakuna

木虫 (知名作家)
你算的是基元反应吗？
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2楼2008-10-02 17:22:52
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阿扑西林

铜虫 (初入文坛)
RCOOR‘+R’‘OH——RCOOR’‘+R’OH
由醇上的R‘’基团取代酯基，在中性条件下进行。我设计为醇上的O-H与酯上的C-O形成一个四边形的过渡态，算出来也只有一个虚频的。

计算活化能的时候，是不是要将RCOOR‘和R’‘OH画在一个文件中，设定一定的键长，然后计算这个反应物复合物的能量？分别计算二者的能量，再加起来是不是会偏大？
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3楼2008-10-02 18:46:25
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mscic

金虫 (正式写手)
RCOOR‘+R’‘OH——RCOOR’‘+R’OH
由醇上的R‘’基团取代酯基，在中性条件下进行。我设计为醇上的O-H与酯上的C-O形成一个四边形的过渡态，算出来也只有一个虚频的。

计算活化能的时候，是不是要将RCOOR‘和R’‘OH画在一个文件中，设定一定的键长，然后计算这个反应物复合物的能量？分别计算二者的能量，再加起来是不是会偏大？


你的做法没问题.
1.请确定你的TS结构是否正确,虚频只是作为TS的一个判据,并不是说只有一个虚频\就是TS.可以看看你的虚频的振动模式是不是能够最终得到产物?
2.如果TS没有问题,那就说明你的这个反应是一个无势垒的反应,比较容易发生.可以采用更高水平的方法计算看看,比较下.
3."计算活化能的时候，是不是要将RCOOR‘和R’‘OH画在一个文件中，设定一定的键长，然后计算这个反应物复合物的能量？"这个是你优化TS的时候做的一个初始猜测吧? 反应物是反应物,别搞混了.
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4楼2008-10-04 12:56:33
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