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阿扑西林

铜虫 (初入文坛)

[交流] 请问活化能计算中,反应物的能量该怎么算

比如一个A+B——C+D的取代反应,中间经历了TS的过渡态,我想计算这个反应的活化能,就分别把A,B和TS的能量算出来(Sum of electronic and zero-point Energies),然后用TS的能量减去A和B的。
但是算得的值是负数。请问我的问题出在哪里?是不是反应物的能量不能将两个分子分开算?
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hakuna

木虫 (知名作家)

你算的是基元反应吗?
2楼2008-10-02 17:22:52
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阿扑西林

铜虫 (初入文坛)

RCOOR‘+R’‘OH——RCOOR’‘+R’OH
由醇上的R‘’基团取代酯基,在中性条件下进行。我设计为醇上的O-H与酯上的C-O形成一个四边形的过渡态,算出来也只有一个虚频的。

计算活化能的时候,是不是要将RCOOR‘和R’‘OH画在一个文件中,设定一定的键长,然后计算这个反应物复合物的能量?分别计算二者的能量,再加起来是不是会偏大?
3楼2008-10-02 18:46:25
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mscic

金虫 (正式写手)

RCOOR‘+R’‘OH——RCOOR’‘+R’OH
由醇上的R‘’基团取代酯基,在中性条件下进行。我设计为醇上的O-H与酯上的C-O形成一个四边形的过渡态,算出来也只有一个虚频的。

计算活化能的时候,是不是要将RCOOR‘和R’‘OH画在一个文件中,设定一定的键长,然后计算这个反应物复合物的能量?分别计算二者的能量,再加起来是不是会偏大?


你的做法没问题.
1.请确定你的TS结构是否正确,虚频只是作为TS的一个判据,并不是说只有一个虚频\就是TS.可以看看你的虚频的振动模式是不是能够最终得到产物?
2.如果TS没有问题,那就说明你的这个反应是一个无势垒的反应,比较容易发生.可以采用更高水平的方法计算看看,比较下.
3."计算活化能的时候,是不是要将RCOOR‘和R’‘OH画在一个文件中,设定一定的键长,然后计算这个反应物复合物的能量?"这个是你优化TS的时候做的一个初始猜测吧? 反应物是反应物,别搞混了.
4楼2008-10-04 12:56:33
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