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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 请高手解释基因组电泳图
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jyxmwhc

铜虫 (小有名气)

[交流] 请高手解释基因组电泳图

电压200v；百分之0.8的琼脂糖凝胶；电泳时间是90分钟；提取方法是苯酚氯仿抽提法。
请指点：1、基因组电泳的条带前面为什么不齐的，前面为什么是圆弧状？
              2、条带后面为什么有拖尾现象

[ Last edited by jyxmwhc on 2008-10-1 at 00:12 ]
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1楼 2008-09-30 22:56:48
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tsingtao2008

木虫 (著名写手)

地球村村民
DNA降解严重（泳道有Smear,呈轨道状），下面亮的部分应是RNA。基因组DNA紧靠样品孔下方，显示纯度低，有蛋白质等杂质，亮度差，表明浓度低。
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钱要流动，人要走动
2楼2008-10-01 06:25:52
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cat_kut

木虫 (小有名气)
我最近一直在做基因组的提取，有些心得跟你分享一下吧。 我同时选用过好几种方法进行抽提。做的时候尽量选用大枪头吸取移液，减少吹打次数。不管是哪种方法，我在pfge中的条带都是smear。不知道你后续工作要做什么，从你的电泳条件来看，我觉得该条件并不是很好的分离条件。大多数人会选用低压过夜分离。如果是想要看看大概size的话，加个marker会好些。如果是想直接做PCR的话，一般我都会直接用，不检测。
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3楼2008-10-01 09:06:40
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jyxmwhc

铜虫 (小有名气)
首先谢谢楼上的两位朋友，再有我对这张电泳图在说明一下，图上最亮的带距离加样孔大概有1.8cm，电泳这么长时间RAN才跑1.8cm吗？DNA的浓度应该比较高，因为我在点样的时候感觉样品很粘稠。至于DNA纯度我没有测。

[ Last edited by jyxmwhc on 2008-10-1 at 09:14 ]
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4楼2008-10-01 09:12:16
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jyxmwhc

铜虫 (小有名气)
3楼朋友：我是对这张图不理解，过去做的电泳图都很好，条带边缘都很整齐，没有smear,我后续工作是想PCR，担心扩不出来，所以检测了一下。
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5楼2008-10-01 09:18:12
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wangyurong

至尊木虫 (著名写手)

none
没有Marker，不好说是不是RAN，我看你的点样空也圆乎乎的，是不是胶没有制好，如果粘稠，极有可能是糖，糖多了造成条带不整齐。
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none
6楼2008-10-01 12:44:45
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jyxmwhc

铜虫 (小有名气)
请其他朋友在发表见解
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7楼2008-10-02 19:29:24
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xiazi221

铜虫 (小有名气)
我认为是降解了，不过做PCR，应该没问题。你跑电泳时，会不会把胶放歪了，造成带不齐。
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8楼2008-10-03 09:43:02
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