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muyunlvyi

金虫 (小有名气)

[求助] 请教pymol高手如何画出以下两幅图~~急于毕业,万分感激!! 已有1人参与

如题,pymol的所有教程都是关于如何显示蛋白,那么核酸分子该如何显示呢,急求大神帮助!

请教pymol高手如何画出以下两幅图~~急于毕业,万分感激!!
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请教pymol高手如何画出以下两幅图~~急于毕业,万分感激!!-1
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lamda

木虫 (著名写手)

笨鸟先飞

前面似乎是晶体结构,后者为NMR或者动力学模拟结果。显示方案,骨架ribbon,侧链stick,颜色方案为灰色。

发自小木虫Android客户端
低调
2楼2016-01-11 21:26:32
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muyunlvyi

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lamda at 2016-01-11 21:26:32
前面似乎是晶体结构,后者为NMR或者动力学模拟结果。显示方案,骨架ribbon,侧链stick,颜色方案为灰色。

都是NMR结构,文献中说是用pymol显示的,不知道第一个是哪种显示模式,这个是核酸结构,请问该如何选侧链和骨架呢?mouse selection mode里面都试过了不行。
3楼2016-01-11 21:35:02
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lamda

木虫 (著名写手)

笨鸟先飞

低调
4楼2016-01-11 21:36:11
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mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果有pdb 格式的文件,蛋白和核算应该都能显示,我以前就用过pymol显示过蛋白和核算的复合物过。
mgfudan
5楼2016-01-11 21:54:05
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muyunlvyi

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by mgfudan at 2016-01-11 21:54:05
如果有pdb 格式的文件,蛋白和核算应该都能显示,我以前就用过pymol显示过蛋白和核算的复合物过。

核酸可以显示,但是怎样才能弄成图中那个样子呢?
6楼2016-01-12 10:07:55
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mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan

引用回帖:
6楼: Originally posted by muyunlvyi at 2016-01-12 10:07:55
核酸可以显示,但是怎样才能弄成图中那个样子呢?...

选择合适的基团,定义后,按照要求显示颜色即可。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

mgfudan
7楼2016-01-12 11:24:34
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muyunlvyi

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by mgfudan at 2016-01-12 11:24:34
选择合适的基团,定义后,按照要求显示颜色即可。...

图一是什么显示模式呢?
8楼2016-01-12 13:36:49
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muyunlvyi

金虫 (小有名气)

如何让dna骨架显示成如图1的条带形式呢?
9楼2016-01-12 15:43:46
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muyunlvyi

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by mgfudan at 2016-01-12 11:24:34
选择合适的基团,定义后,按照要求显示颜色即可。...

能不能具体说一下,核酸如何来区别选择骨架和侧链呢?谢谢谢谢谢谢谢谢!
10楼2016-01-12 15:50:31
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