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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 请教pymol高手如何画出以下两幅图~~急于毕业，万分感激！！
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muyunlvyi

金虫 (小有名气)

[求助] 请教pymol高手如何画出以下两幅图~~急于毕业，万分感激！！ 已有1人参与

如题，pymol的所有教程都是关于如何显示蛋白，那么核酸分子该如何显示呢，急求大神帮助！

请教pymol高手如何画出以下两幅图~~急于毕业，万分感激！！
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请教pymol高手如何画出以下两幅图~~急于毕业，万分感激！！-1
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1楼 2016-01-11 21:19:44
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lamda

木虫 (著名写手)

笨鸟先飞
前面似乎是晶体结构，后者为NMR或者动力学模拟结果。显示方案，骨架ribbon，侧链stick，颜色方案为灰色。

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2楼2016-01-11 21:26:32
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muyunlvyi

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lamda at 2016-01-11 21:26:32
前面似乎是晶体结构，后者为NMR或者动力学模拟结果。显示方案，骨架ribbon，侧链stick，颜色方案为灰色。

都是NMR结构，文献中说是用pymol显示的，不知道第一个是哪种显示模式，这个是核酸结构，请问该如何选侧链和骨架呢？mouse selection mode里面都试过了不行。
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3楼2016-01-11 21:35:02
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lamda

木虫 (著名写手)

笨鸟先飞
命令行输入就可以了

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4楼2016-01-11 21:36:11
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mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果有pdb 格式的文件，蛋白和核算应该都能显示，我以前就用过pymol显示过蛋白和核算的复合物过。
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mgfudan
5楼2016-01-11 21:54:05
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muyunlvyi

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by mgfudan at 2016-01-11 21:54:05
如果有pdb 格式的文件，蛋白和核算应该都能显示，我以前就用过pymol显示过蛋白和核算的复合物过。

核酸可以显示，但是怎样才能弄成图中那个样子呢？
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6楼2016-01-12 10:07:55
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mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan
引用回帖:
6楼: Originally posted by muyunlvyi at 2016-01-12 10:07:55
核酸可以显示，但是怎样才能弄成图中那个样子呢？...

选择合适的基团，定义后，按照要求显示颜色即可。
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muyunlvyi
mgfudan
7楼2016-01-12 11:24:34
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muyunlvyi

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by mgfudan at 2016-01-12 11:24:34
选择合适的基团，定义后，按照要求显示颜色即可。...

图一是什么显示模式呢？
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8楼2016-01-12 13:36:49
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muyunlvyi

金虫 (小有名气)
如何让dna骨架显示成如图1的条带形式呢？
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9楼2016-01-12 15:43:46
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muyunlvyi

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by mgfudan at 2016-01-12 11:24:34
选择合适的基团，定义后，按照要求显示颜色即可。...

能不能具体说一下，核酸如何来区别选择骨架和侧链呢？谢谢谢谢谢谢谢谢！
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10楼2016-01-12 15:50:31
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