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asym

金虫 (著名写手)

[交流] 菜鸟求问怎么没有氢键的标准偏差

D   H   A   D - H  H...A   D...A    D - H...A  symm(A)
#
N1      H1      O1          0.8600     2.0000   2.844(4)     166.00   4_846 yes
这是我用PLATON处理CIF得到的氢键数据,为什么没有D - H  H...A D - H...A 0.86(?) 2.0(?) 2.84(?)的偏差,()中的数应该是偏差吧?请大虫指教,谢谢。
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

4_846

假设某个空间群,
他的一般位置的等效点系是4个,
意思就是一个单胞里,每个独立的原子,可以通过对称操作变出另外三个原子来。
加上不变操作"x, y, z", 这样, 共有4个对称操作。

4表示第4个对称操作。
_ 后面的三个数字分别表示在a, b, c三个方向的平移。
5不平移,
846表示在a正方向平移 3个单胞, 在b负方向平移1个单胞,在c正方向平移1个单胞.

举例来说:
假设4对应的对称操作码是 -x, -y, -z
那么4_846 就是 3-x, -1-y, 1-z
xi2004-emuch@163.com
6楼2008-09-29 10:39:08
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查看全部 8 个回答

xi2004

至尊木虫 (职业作家)


asym(金币+1,VIP+0):thanks
因为你的是理论加的氢.
xi2004-emuch@163.com
2楼2008-09-28 22:06:10
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wwt1806

木虫 (正式写手)


asym(金币+1,VIP+0):thanks
理论加氢的话只有 D - H...A    的距离有偏差,其他的距离没有偏差。
鲲鹏展翅行千里,他日无风假何物?
3楼2008-09-28 22:18:33
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vink

木虫 (著名写手)

理论嘉庆

[ Last edited by vink on 2008-9-30 at 14:18 ]
4楼2008-09-29 07:34:54
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