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yan1992

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教串联质谱数据分析 已有1人参与

本人微生物学专业,质谱小白,求大神赐教!!!
最近利用Agilent 6460 QQQ鉴定发酵液中脂肽类抗生素结构,看文献大多利用Data analysis 4.0 (Bruker Daltonics, Bremen Germany)来确定肽键断裂产生的b、y型离子,从而得到脂肽类物质结构。
但是我们这没有这个分析软件,想问问还有没有其他分析软件来确定b、y型离子或者结构?谢谢啦!!
附图是参考文献中的分析结果图

请教串联质谱数据分析
搜狗截图16年01月06日1526_1.png
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紫筱枫影

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

在没有软件的情况下,可以自己分析。
左边N端,右边C端。
由于蛋白质基本结构由肽键构成,肽键断裂的方式有ax、by、cz三种。by那里就是肽键。
所产生的碎片离子分别为a、b、c、x、y、z六种类型。含有 N terminal 碎片离子称为:a, b or c;含有C terminal的碎片离子称为: x, y or z.
比如你给的图,向左弯的是abc,向右弯的是xyz。肽键那里是b1y1     b2y2     b3y3
8楼2017-07-17 14:44:13
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vegue

银虫 (小有名气)

★ ★
yan1992(200782060代发): 金币+2, 感谢交流 2016-01-17 17:18:32
MaxQuant可以吧?还有Protein Prospector

发自小木虫Android客户端
2楼2016-01-09 01:32:47
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yan1992

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by vegue at 2016-01-09 01:32:47
MaxQuant可以吧?还有Protein Prospector

谢谢!我试试,英语渣自学各种软件太困难了
3楼2016-01-09 18:01:37
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氺泽兮木兰

新虫 (初入文坛)

请问一下有没有data analysis的安装包,能不能发我一下,谢谢

发自小木虫Android客户端
4楼2017-07-06 10:00:17
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