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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 分析 » 质谱分析 » 请教串联质谱数据分析
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yan1992

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教串联质谱数据分析 已有1人参与

本人微生物学专业，质谱小白，求大神赐教！！！
最近利用Agilent 6460 QQQ鉴定发酵液中脂肽类抗生素结构，看文献大多利用Data analysis 4.0 (Bruker Daltonics, Bremen Germany)来确定肽键断裂产生的b、y型离子，从而得到脂肽类物质结构。
但是我们这没有这个分析软件，想问问还有没有其他分析软件来确定b、y型离子或者结构？谢谢啦！！
附图是参考文献中的分析结果图

请教串联质谱数据分析
搜狗截图16年01月06日1526_1.png
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1楼 2016-01-06 15:29:25
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vegue

银虫 (小有名气)
★ ★
yan1992(200782060代发): 金币+2, 感谢交流 2016-01-17 17:18:32
MaxQuant可以吧？还有Protein Prospector

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2楼2016-01-09 01:32:47
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yan1992

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by vegue at 2016-01-09 01:32:47
MaxQuant可以吧？还有Protein Prospector

谢谢！我试试，英语渣自学各种软件太困难了
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3楼2016-01-09 18:01:37
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氺泽兮木兰

新虫 (初入文坛)
请问一下有没有data analysis的安装包，能不能发我一下，谢谢

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4楼2017-07-06 10:00:17
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赵文华110

银虫 (正式写手)
我可以使用Protein Prospector，帮你把蛋白分析出来，但我只会找到蛋白的分子量以及所带电荷，具体结构分析没做过
赞一下(1人) 回复此楼
我相信我就是我，我相信明天，我相信青春没有地平线
5楼2017-07-07 16:28:36
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hjzxzzx

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 氺泽兮木兰 at 2017-07-06 10:00:17
请问一下有没有data analysis的安装包，能不能发我一下，谢谢

你有找到安装包吗
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6楼2017-07-11 16:51:29
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氺泽兮木兰

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hjzxzzx at 2017-07-11 16:51:29
你有找到安装包吗...

没有

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7楼2017-07-12 13:21:24
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紫筱枫影

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

在没有软件的情况下，可以自己分析。
左边N端，右边C端。
由于蛋白质基本结构由肽键构成，肽键断裂的方式有ax、by、cz三种。by那里就是肽键。
所产生的碎片离子分别为a、b、c、x、y、z六种类型。含有 N terminal 碎片离子称为：a, b or c；含有C terminal的碎片离子称为： x, y or z.
比如你给的图，向左弯的是abc，向右弯的是xyz。肽键那里是b1y1     b2y2     b3y3
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8楼2017-07-17 14:44:13
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