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相似的分子对接结果相差很多 已有1人参与
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各位前辈，我利用autodock将曙红B与罗丹明B分别与BSA做对接。 同一位点，对接完后，两个相似的分子，结果却是曙红B对接不上（affinity大于0） 这是二者的结构式  曙红B 罗丹明B我发现这两个分子对接完后，曙红B的中心C原子变绿，而罗丹明B的没有变绿。这是为什么？这会不会影响到对接效果？  曙红B 罗丹明B为什么小分子对接完后，碳骨架会显示白色？而其它周边C原子（如羧基上的C）仍是绿色？ |
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