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【求助】用ADT做含氯配体时出错
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当我准备含氯原子的配体的pdbqt文件时，在Ligand->input->open->name.pdbqt时出现了以下提示，但当我采用相同步骤准备含氟和溴的配体文件时却没有问题。请各位虫友帮忙，谢谢。 错误提示： >>> ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\ViewerFramework\VF.py", line 716, in tryto File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\autotorsCommands.py", line 984, in doit File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\autotorsCommands.py", line 287, in initLPO4 File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 939, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 702, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 1373, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 1411, in __classifyBonds File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\AutoDockBondClassifier.py", line 57, in classify File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\MolKit\bondSelector.py", line 529, in select File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\MolKit\bondSelector.py", line 505, in select File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\atomTypes.py", line 137, in assignHybridization self.valence_two() File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\atomTypes.py", line 263, in valence_two angle1 = bond_angle(k.coords, a.coords, l.coords) File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\util.py", line 48, in bond_angle (a[2] - b[2]) * (c[2] - b[2]) ) / dist ZeroDivisionError: float division |
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