| 查看: 109 | 回复: 0 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助】用ADT做含氯配体时出错
|
|||
|
当我准备含氯原子的配体的pdbqt文件时，在Ligand->input->open->name.pdbqt时出现了以下提示，但当我采用相同步骤准备含氟和溴的配体文件时却没有问题。请各位虫友帮忙，谢谢。 错误提示： >>> ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\ViewerFramework\VF.py", line 716, in tryto File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\autotorsCommands.py", line 984, in doit File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\autotorsCommands.py", line 287, in initLPO4 File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 939, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 702, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 1373, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 1411, in __classifyBonds File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\AutoDockBondClassifier.py", line 57, in classify File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\MolKit\bondSelector.py", line 529, in select File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\MolKit\bondSelector.py", line 505, in select File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\atomTypes.py", line 137, in assignHybridization self.valence_two() File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\atomTypes.py", line 263, in valence_two angle1 = bond_angle(k.coords, a.coords, l.coords) File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\util.py", line 48, in bond_angle (a[2] - b[2]) * (c[2] - b[2]) ) / dist ZeroDivisionError: float division |
回复此楼» 猜你喜欢
瑞典林雪平大学博士后招聘｜PEC Water Splitting 方向
已经有130人回复
-
PRB投稿，Acknowledgment sent to author状态十天了
已经有3人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有278人回复
-
PVA溶解
已经有2人回复
-
基金申请
已经有44人回复
-
CSC与新西兰维多利亚大学PhD奖学金项目
已经有0人回复
-
新西兰Robinson研究所 招聘CSC公派访问人员
已经有0人回复
-
帮我的英语口语老师找学生
已经有0人回复
-
什么时候开奖？
已经有6人回复
-
散金币祈福
已经有35人回复
