| 查看: 93 | 回复: 0 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助】用ADT做含氯配体时出错
|
|||
|
当我准备含氯原子的配体的pdbqt文件时，在Ligand->input->open->name.pdbqt时出现了以下提示，但当我采用相同步骤准备含氟和溴的配体文件时却没有问题。请各位虫友帮忙，谢谢。 错误提示： >>> ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\ViewerFramework\VF.py", line 716, in tryto File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\autotorsCommands.py", line 984, in doit File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\autotorsCommands.py", line 287, in initLPO4 File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 939, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 702, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 1373, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 1411, in __classifyBonds File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\AutoDockBondClassifier.py", line 57, in classify File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\MolKit\bondSelector.py", line 529, in select File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\MolKit\bondSelector.py", line 505, in select File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\atomTypes.py", line 137, in assignHybridization self.valence_two() File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\atomTypes.py", line 263, in valence_two angle1 = bond_angle(k.coords, a.coords, l.coords) File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\util.py", line 48, in bond_angle (a[2] - b[2]) * (c[2] - b[2]) ) / dist ZeroDivisionError: float division |
回复此楼» 猜你喜欢
重庆交大26年硕士生招生拟调剂通知已出！欢迎加入光子学微结构与器件课题组。
已经有0人回复
-
UJN物理学专业调剂
已经有12人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有133人回复
-
北京纳米能源与系统研究所王中林院士/曹南颖研究员课题组招收2026硕士研究生1名
已经有0人回复
-
山西大同大学物理学硕士研究生招收调剂生
已经有0人回复
-
[调剂信息]211智能人工感知方向国家青年特聘专家课题组招收调剂研究生
已经有0人回复
-
［调剂信息］211智能人工感知方向国家青年特聘专家课题组招收调剂研究生
已经有0人回复
-
[调剂信息]211智能人工感知方向国家青年特聘专家课题组招收调剂研究生
已经有0人回复
-
一志愿物理所凝聚态物理352求调剂
已经有0人回复
-
0702一志愿吉大B区求调剂 本科期间发表一篇Sci
已经有0人回复
