| 查看: 133 | 回复: 0 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助】用ADT做含氯配体时出错
|
|||
|
当我准备含氯原子的配体的pdbqt文件时，在Ligand->input->open->name.pdbqt时出现了以下提示，但当我采用相同步骤准备含氟和溴的配体文件时却没有问题。请各位虫友帮忙，谢谢。 错误提示： >>> ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\ViewerFramework\VF.py", line 716, in tryto File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\autotorsCommands.py", line 984, in doit File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\autotorsCommands.py", line 287, in initLPO4 File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 939, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 702, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 1373, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 1411, in __classifyBonds File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\AutoDockBondClassifier.py", line 57, in classify File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\MolKit\bondSelector.py", line 529, in select File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\MolKit\bondSelector.py", line 505, in select File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\atomTypes.py", line 137, in assignHybridization self.valence_two() File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\atomTypes.py", line 263, in valence_two angle1 = bond_angle(k.coords, a.coords, l.coords) File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\util.py", line 48, in bond_angle (a[2] - b[2]) * (c[2] - b[2]) ) / dist ZeroDivisionError: float division |
回复此楼» 猜你喜欢
深圳大学应用技术学院招聘凝聚态物理博士后
已经有124人回复
-
求助中医院临床中医中标的青年标书学习，谢谢
已经有5人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有162人回复
-
浙大物院表面物理课题组长期招收普博及直博学生
已经有259人回复
-
【征稿】Springer Nature热电专题 Discover Materials / Discover Chemistry
已经有47人回复
-
25届硕士申请，材料计算方向
已经有2人回复
-
课题组招1-2名硕士
已经有1人回复
-
机时越来越贵之后，我把一部分 DFT 流程搬到了 AI 计算平台上
已经有0人回复
-
斯坦福大学与Elsevier世界前2%学者新排名查询
已经有0人回复
-
27申博推荐：南京航空航天大学国际前沿院光学方向招收博士生！
已经有19人回复