| 查看: 87 | 回复: 0 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助】用ADT做含氯配体时出错
|
|||
|
当我准备含氯原子的配体的pdbqt文件时，在Ligand->input->open->name.pdbqt时出现了以下提示，但当我采用相同步骤准备含氟和溴的配体文件时却没有问题。请各位虫友帮忙，谢谢。 错误提示： >>> ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\ViewerFramework\VF.py", line 716, in tryto File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\autotorsCommands.py", line 984, in doit File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\autotorsCommands.py", line 287, in initLPO4 File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 939, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 702, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 1373, in __init__ File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\MoleculePreparation.py", line 1411, in __classifyBonds File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\AutoDockBondClassifier.py", line 57, in classify File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\MolKit\bondSelector.py", line 529, in select File "C:\cygwin\home\mgl\releases\MGLToolsPckgs\MolKit\bondSelector.py", line 505, in select File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\atomTypes.py", line 137, in assignHybridization self.valence_two() File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\atomTypes.py", line 263, in valence_two angle1 = bond_angle(k.coords, a.coords, l.coords) File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.2\MGLToolsPckgs\PyBabel\util.py", line 48, in bond_angle (a[2] - b[2]) * (c[2] - b[2]) ) / dist ZeroDivisionError: float division |
回复此楼» 猜你喜欢
反铁磁体中的磁性切换：两种不同的机制已成功可视化
已经有0人回复
-
求标准粉末衍射卡号 ICDD 01-076-1802
已经有0人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有51人回复
-
新西兰Robinson研究所招收全奖PhD
已经有0人回复
-
石墨烯转移--二氧化硅衬底石墨烯
已经有0人回复
-
笼目材料中量子自旋液体基态的证据
已经有0人回复
-
数学教学论硕士可以读数学物理博士吗？
已经有0人回复
-
德国亥姆霍兹Hereon中心汉堡分部招镁合金腐蚀裂变SCC课题方向2026公派博士生
已经有4人回复
-
澳门大学 应用物理及材料工程研究院 潘晖教授课题组诚招博士后
已经有11人回复