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wang369

木虫 (职业作家)

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[资源] AutoDock Tools在Ubuntu Kylin14、Ubuntu Kylin15下安装的详细安装步骤（原创）

自己在摸索的过程中发现很多人有相似的问题，没有解决，故把自己的经历分享出来。

AutoDock Tools在Ubuntu Kylin14、Ubuntu Kylin15下安装的详细安装步骤：

Mgltools安装

Ubuntu Kylin14、Ubuntu Kylin15下安装：
Home文件夹即主文件夹下新建一个文件夹autodock（文件夹可以自己随意新建设置）；
1.登11.mgltools官网，下载mgltools_x86_64Linux2_1.5.6.tar.gz（下载符合电脑硬件的安装包）
2.    2. 双击下载到的mgltools_x86_64Linux2_1.5.6.tar.gz文件，解压到autodock文件夹，解压后，重命名刚刚解压得到的文件mgltools_x86_64Linux2_1.5.6.为mgltools。
3.    ctrl+alt+T调用命令终端或手动打开命令终端；
3.具体操作：先cd回车；
                  再ls回车；看到autodock文件夹；
                  cd program回车；看到mgltools文件夹；

                  cd mgltools回车。如下图所示：
4. 运行
      ./install.sh（注：..../program/mgltools/：./install.sh）
5.安装过程稍等一回，会在结束之前弹出对话框说明某些部分的相关使用条款，确定即可
6. 参照命令终端给出的提示：
To run pmv, adt, vision or pythonsh scripts located at:
/home/username/program/mgltools/bin
you will need to do ONE of the following:

-- add the /home /aspirin/autodock /mgltools/bin to the path environmentvariable in .cshrc or .bashrc:
.cshrc:
set path = (/home/ aspirin/autodock /mgltools/bin $path)

.bashrc
export PATH=/home/ aspirin/autodock /mgltools/binPATH

-- create aliases in your .cshrc or .bashrc
.cshrc:
alias pmv /home/ aspirin/autodock /mgltools/bin/pmv
alias adt /home/ aspirin/autodock /mgltools/bin/adt
alias vision /home/ aspirin/autodock /mgltools/bin/vision
alias pythonsh /home /aspirin/autodock /mgltools/bin/pythonsh

.bashrc
aliaspmv='/home/aspirin/autodock/mgltools/bin/pmv'
alias adt='/home/ aspirin/autodock /mgltools/bin/adt'
alias vision='/home/ aspirin/autodock /mgltools/bin/vision'
alias pythonsh='/home/ aspirin/autodock /mgltools/bin/pythonsh'（如上图所示）
这里选用最后一种方法，通过更改.bashrc文件的方法实现，具体为：
打开home文件夹即主文件夹，ctrl+H显示隐藏的文件（再按一次，取消隐藏），找到.bahsrc文件，打开（和win中使用记事本打开文件一样的方法），在文档最后部分添加刚才复制到的代码，具体这里是这样做的：
#############ADT start#################
alias pmv='/home/ aspirin/autodock /mgltools/bin/pmv'
alias adt='/home/ aspirin/autodock /mgltools/bin/adt'
alias vision='/home/ aspirin/autodock /mgltools/bin/vision'
alias pythonsh='/home/ aspirin/autodock /mgltools/bin/pythonsh'
#############ADT end################
7. 在刚才安装时使用的命令终端（当然，也可以在其他命令终端）输入source./initMGLtools.sh(具体看自己命令端的显示)回车；
8. cd回车切换至主文件即home文件夹；
输入adt,回车；

注：附件有详细的步骤和图片。详细的步骤和图片。详细的步骤和图片。
生物分子模拟论坛：http://bioms.org/thread-2219-1-1.html

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附件 1 : ubuntukylin14.04LTS安装mgltools(AutoDock_Tools)方法.docx

2015-12-31 23:17:34, 957.81 K