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white雪儿

金虫 (小有名气)

[求助] 使用MS计算自由体积的问题

想求助一下,使用MS计算自由体积,我的步骤是,激活xtd文件,然后tools-atom volumes&surfaces来计算。这样做有问题吗?

还有我计算两种压力条件下模型的自由体积,100MPa和2MPa下,跑完动力学后,看到各自的体积不同,但是计算自由体积时,得到的自由体积、占有体积的数值完全相同。
这是什么情况?求助各位,非常感谢您的帮助!
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white雪儿

金虫 (小有名气)

有计算自由体积的同学吗??
2楼2016-01-05 15:15:11
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white雪儿

金虫 (小有名气)

我计算的不同压力下,氧气在聚合物中的扩散系数不同,但是自由体积却是相同的,还有氧气的运动轨迹也是相同的,有遇到同样情况的童鞋吗??
3楼2016-01-05 15:30:39
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liji3b109

新虫 (小有名气)

4楼2016-01-10 21:17:06
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white雪儿

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by liji3b109 at 2016-01-10 21:17:06
能具体说说吗?

具体的情况 我在一楼描述啦 你看还有哪些该补充的信息?我想不到啦

发自小木虫Android客户端
5楼2016-01-12 07:33:45
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liji3b109

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by white雪儿 at 2016-01-12 07:33:45
具体的情况 我在一楼描述啦 你看还有哪些该补充的信息?我想不到啦
...

数据完全一样还是略有差别?

发自小木虫Android客户端
6楼2016-01-12 08:03:13
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liji3b109

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by liji3b109 at 2016-01-12 08:03:13
数据完全一样还是略有差别?
...

还有可能压力太大了,分子都被完全挤一块去了。

发自小木虫Android客户端
7楼2016-01-12 08:04:30
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white雪儿

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by liji3b109 at 2016-01-12 08:04:30
还有可能压力太大了,分子都被完全挤一块去了。
...

分子运动轨迹完全一样,但是计算MSD不一样。
计算自由体积,得到的数值也是完全一样的。

压力大,分子被挤一块了,这样的话,和大气压下的数据应该有差别呀,可是轨迹和自由体积居然毫无差别。
8楼2016-01-12 09:57:28
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liji3b109

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by white雪儿 at 2016-01-12 09:57:28
分子运动轨迹完全一样,但是计算MSD不一样。
计算自由体积,得到的数值也是完全一样的。

压力大,分子被挤一块了,这样的话,和大气压下的数据应该有差别呀,可是轨迹和自由体积居然毫无差别。...

这个不科学啊

发自小木虫Android客户端
9楼2016-01-12 18:24:09
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