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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 使用MS计算自由体积的问题
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white雪儿

金虫 (小有名气)

[求助] 使用MS计算自由体积的问题

想求助一下，使用MS计算自由体积，我的步骤是，激活xtd文件，然后tools-atom volumes&surfaces来计算。这样做有问题吗？

还有我计算两种压力条件下模型的自由体积，100MPa和2MPa下，跑完动力学后，看到各自的体积不同，但是计算自由体积时，得到的自由体积、占有体积的数值完全相同。
这是什么情况？求助各位，非常感谢您的帮助！
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1楼 2015-12-29 22:18:44
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white雪儿

金虫 (小有名气)
有计算自由体积的同学吗？？
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2楼2016-01-05 15:15:11
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white雪儿

金虫 (小有名气)
我计算的不同压力下，氧气在聚合物中的扩散系数不同，但是自由体积却是相同的，还有氧气的运动轨迹也是相同的，有遇到同样情况的童鞋吗？？
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3楼2016-01-05 15:30:39
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liji3b109

新虫 (小有名气)
能具体说说吗？

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4楼2016-01-10 21:17:06
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white雪儿

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by liji3b109 at 2016-01-10 21:17:06
能具体说说吗？

具体的情况 我在一楼描述啦 你看还有哪些该补充的信息？我想不到啦

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5楼2016-01-12 07:33:45
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liji3b109

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by white雪儿 at 2016-01-12 07:33:45
具体的情况 我在一楼描述啦 你看还有哪些该补充的信息？我想不到啦
...

数据完全一样还是略有差别？

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6楼2016-01-12 08:03:13
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liji3b109

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by liji3b109 at 2016-01-12 08:03:13
数据完全一样还是略有差别？
...

还有可能压力太大了，分子都被完全挤一块去了。

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7楼2016-01-12 08:04:30
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white雪儿

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by liji3b109 at 2016-01-12 08:04:30
还有可能压力太大了，分子都被完全挤一块去了。
...

分子运动轨迹完全一样，但是计算MSD不一样。
计算自由体积，得到的数值也是完全一样的。

压力大，分子被挤一块了，这样的话，和大气压下的数据应该有差别呀，可是轨迹和自由体积居然毫无差别。
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8楼2016-01-12 09:57:28
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liji3b109

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by white雪儿 at 2016-01-12 09:57:28
分子运动轨迹完全一样，但是计算MSD不一样。
计算自由体积，得到的数值也是完全一样的。

压力大，分子被挤一块了，这样的话，和大气压下的数据应该有差别呀，可是轨迹和自由体积居然毫无差别。...

这个不科学啊

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9楼2016-01-12 18:24:09
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