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维特的日记

木虫 (小有名气)

[求助] 二氧化硅包裹烷烃的核壳结构模拟温度和能量不守恒问题 已有1人参与

本人最近一段时间在模拟二氧化硅包裹烷烃的核壳结构,模型是在烷烃的xy方向周围包裹一层二氧化硅,即xy方向是非周期的、z方向是周期的,类似于长方体形状的管道。势函数二氧化硅采用tersoff,烷烃使用Trappe,他们之间的相互作用用lj势。目前在270K下弛豫100万步了,再转到nve弛豫100万步,时间步长为0.1fs。然后出现问题了,模型在270K的nvt弛豫温度还算正常在270上下小幅度振荡,但是体系的总能量不断减小,烷烃的总能量不断增大,二氧化硅的总能量不断减小。nve系综的问题更大,温度随着运行时间缓慢上升,总能量是守恒的,二氧化硅的总能量不断下降,烷烃的总能量不断升高。一开始我以为是时间步长的问题,所以才改成了0.1fs,起初是1fs的,但是改成0.1fs还是不能解决问题。希望虫友们能够帮帮忙,解决这个问题。如下是nvt系综的几个图,nve没有运行万就被我关了,因为已经出现问题了。

二氧化硅包裹烷烃的核壳结构模拟温度和能量不守恒问题
1.png


二氧化硅包裹烷烃的核壳结构模拟温度和能量不守恒问题-1
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二氧化硅包裹烷烃的核壳结构模拟温度和能量不守恒问题-2
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二氧化硅包裹烷烃的核壳结构模拟温度和能量不守恒问题-3
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looyady

金虫 (小有名气)

你好,请问你怎么使用LAMMPS做的二氧化硅的壳核结构?能发一份儿in文件给下参考吗?
7楼2019-03-25 21:06:11
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查看全部 7 个回答

fuhuidong

铁杆木虫 (知名作家)

你是用什么软件模拟的
奇迹来自不断的探索
2楼2015-12-26 21:55:34
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维特的日记

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fuhuidong at 2015-12-26 21:55:34
你是用什么软件模拟的

lammps

发自小木虫IOS客户端
3楼2015-12-26 22:11:45
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fuhuidong

铁杆木虫 (知名作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 维特的日记 at 2015-12-26 22:11:45
lammps
...

这个软件没有用过

发自小木虫Android客户端
奇迹来自不断的探索
4楼2015-12-27 09:51:54
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