24小时热门版块排行榜    

查看: 6450  |  回复: 18
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 jinbei 的 5 个金币

不取俗名

木虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by jinbei at 2015-12-25 17:19:42
谢谢,离子对是不是就是阴阳离子合在一起,进行构型优化?

感谢您的回复。感觉对这个构型有了一定的理解。...



发自小木虫Android客户端
11楼2015-12-25 17:29:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jinbei

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 不取俗名 at 2015-12-25 16:59:40
我没用Gaussianview算过,我都直接写gjf的,要设置电荷,多重度,阳离子是1,1
阴离子是-1,1
离子对是1,1
...

你好,再请教一个问题,在GAUSSION VIEW里面,构型优化完成后的阳离子和阴离子如何组合成离子对?怎么将能量最低的阴阳离子合并呢?
是不是可以将阴阳离子通过用户定义碎片(custom Fragmant)入库,再添加到VIEW里面?

请问你是怎么处理的?谢谢。自己手写吗?
12楼2015-12-26 14:30:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

不取俗名

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
12楼: Originally posted by jinbei at 2015-12-26 14:30:12
你好,再请教一个问题,在GAUSSION VIEW里面,构型优化完成后的阳离子和阴离子如何组合成离子对?怎么将能量最低的阴阳离子合并呢?
是不是可以将阴阳离子通过用户定义碎片(custom Fragmant)入库,再添加到VIEW ...

打开一个文件,再打开另一个文件的时候方式专业append all...什么的,具体我忘了,你自己找找看,然后按照化学常识,拖动到你的初始位置,再优化

发自小木虫Android客户端
13楼2015-12-26 14:39:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jimsmart

捐助贵宾 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
jinbei: 金币+5 2015-12-28 11:55:08
计算本身是一个模拟的过程,你这样的模型是比较简单快捷的一种.
先试算一下再说,看结果如何.
后面,可以修改两种分子的比例,进而不断提升计算的水平.
14楼2015-12-28 08:46:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

浮云哥哥

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by 不取俗名 at 2015-12-25 08:08:08
通常的做法是先优化单体,做个esp分析,按照化学常识初步摆放,这一定程度上决定了优化成功与否,再优化dimer

请问如何做esp分析?
15楼2015-12-28 17:02:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

不取俗名

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
15楼: Originally posted by 浮云哥哥 at 2015-12-28 17:02:48
请问如何做esp分析?...

高斯就能做,具体步骤网上很多

发自小木虫Android客户端
16楼2015-12-28 17:05:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songersing

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主,我最近想学高斯,求指教
17楼2016-06-05 09:32:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

义~~~~~

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
大牛  你的问题解决了吗?  最近也遇到这个问题  求告知
18楼2017-12-21 16:41:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

苏格拉没有地

铁虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问楼主现在知道怎么优化了吗?
19楼2018-06-04 13:58:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jinbei 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 每次骚扰女学生的都是院系领导,而不是普通教师,小编们要注意措辞正确 +7 zju2000 2024-06-15 9/450 2024-06-15 22:54 by zeolitess
[考博] 上海交大招收材料化学方向科研助理/“申请考核”博士(请勿回复帖子或站内投条) +3 灵梦and紫 2024-06-12 4/200 2024-06-15 20:58 by 1822836277
[基金申请] Nature 11日发文,中国著名学者们称造假迫不得已 +5 babu2015 2024-06-14 5/250 2024-06-15 20:40 by lc231001
[基金申请] 希望今年自己国自然面上项目和老婆青年项目能中! +5 恐龙爸爸 2024-06-14 5/250 2024-06-15 20:36 by wanghuawei
[论文投稿] 审稿人含糊拒稿,还需要回复吗?如何回复? 20+3 BruceChum 2024-06-15 17/850 2024-06-15 20:19 by arthas_007
[找工作] 江西双非一本和四川双一流高校如何选择? 5+7 寒山敲钟 2024-06-12 22/1100 2024-06-15 20:00 by LittleBush
[硕博家园] 博士毕业高校和就业的相关问题 +4 SCITOPPP 2024-06-14 6/300 2024-06-15 18:54 by SCITOPPP
[博后之家] 山东大学(青岛)“天然药物生物智造”课题组 招聘“博士后”(年薪20.4-55.6万元) +3 第二种态度 2024-06-11 5/250 2024-06-15 17:56 by 小懂事k
[有机交流] 车间生产,真空度很高,温度很高,但减压蒸馏速度很慢。 10+12 召唤鬼泣lL 2024-06-13 35/1750 2024-06-15 16:14 by 老钱秀
[论文投稿] 投稿时忘记修改一作 +7 gll123456 2024-06-13 11/550 2024-06-15 11:49 by gll123456
[论文投稿] 求机械类四区sci推荐 5+3 迷茫小旷 2024-06-14 4/200 2024-06-15 11:25 by bobvan
[基金申请] 有没有机械的前辈分享一下评上海优都是什么成果啊 +7 wulala800 2024-06-10 7/350 2024-06-15 09:33 by 晓目崇
[食品] 食品博士导师 +6 小李醒yy 2024-06-11 9/450 2024-06-14 23:37 by 小李醒yy
[考研] 物理化学一对一辅导 +3 林大diao 2024-06-12 5/250 2024-06-14 20:57 by 林大diao
[硕博家园] 关于硕博连读的一些疑问? +4 Lwenter 2024-06-14 4/200 2024-06-14 14:32 by ou0551
[找工作] 应届大龄土博教职选择,石河子大学和广西大学 10+4 茅山老道士 2024-06-10 31/1550 2024-06-14 10:40 by ChmistryCHEN
[有机交流] 旋蒸请教 +6 办公室摸鱼 2024-06-09 9/450 2024-06-13 21:31 by wuxiaominggo
[基金申请] 连续两年医学口青年项目初审体会 +11 进击的荣耀 2024-06-09 18/900 2024-06-13 17:27 by 进击的荣耀
[基金申请] 博后特助这周出结果吗?往年都是啥时候啊? +13 jsqy 2024-06-12 17/850 2024-06-12 19:55 by Lynn212
[论文投稿] water research状态咨询 5+3 Flyyawa 2024-06-10 6/300 2024-06-11 09:45 by bobvan
信息提示
请填处理意见