应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 求助用MD建立模型，Amorphous cell Construction出错是怎么回事
71/1返回列表
查看: 2561  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

hepetter

银虫 (正式写手)

[求助] 求助用MD建立模型，Amorphous cell Construction出错是怎么回事 已有3人参与

我想用聚天冬氨酸为研究对象，运用分子动力学方法在方解石的晶面上进行动态模拟。
构建聚合物后总是出现下面的问题，只怎么回事？
求高手指教下，多谢了！！

求助用MD建立模型，Amorphous cell Construction出错是怎么回事
1.png


求助用MD建立模型，Amorphous cell Construction出错是怎么回事-1
2.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-12-22 15:33:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Friday

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你按yes， 会有一个txt文件，里面会有错误信息，贴出来看看。。。。

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2015-12-22 16:38:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hepetter

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Friday at 2015-12-22 16:38:54
你按yes， 会有一个txt文件，里面会有错误信息，贴出来看看。。。。

这个你帮忙看下
求助用MD建立模型，Amorphous cell Construction出错是怎么回事-2
QQ图片20151222200559.png
赞一下 回复此楼
3楼2015-12-22 20:06:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Friday

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

文件夹下会有两个.txt的文件 一个是status.txt 另一个是 名字.txt 你把第二个打开看看

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2015-12-23 07:40:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zsilence

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

密度太大 链节太长。。。反正就是参数不合理吧
赞一下 回复此楼
5楼2015-12-25 15:52:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

焦卫卫

新虫 (初入文坛)
您好，关于上边说的问题，不知道您有没有解决？
最近也在用Amorphous cell Construction，Constituent molecules分子数为1时就能建成，改变分子数就会出现上述相同的错误提示？
希望能给予帮助，谢谢！
赞一下 回复此楼
6楼2016-07-01 13:04:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木鱼三生石

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你看一下construction窗口下molecule的名称和这个原3D文件打开时，左下角信息中，下拉菜单molecule中的name名称是否一致呢？是不是sketch1？那就需要改成一样的名称，双击sketch 1重新命名一个名字，然后重新添加到construction中，再建了看看
赞一下 回复此楼
7楼2016-07-08 11:06:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hepetter 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0854电子信息求调剂 +3 α____ 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:28 by zhq0425
[考研] 一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂 +11 枫桥ZL 2026-03-18 13/650 2026-03-22 20:26 by edmund7
[考研] 一志愿武理材料工程348求调剂 +5 ￣^￣゜汗 2026-03-19 7/350 2026-03-22 19:44 by 公瑾逍遥
[考研] 环境学硕288求调剂 +6 皮皮皮123456 2026-03-22 6/300 2026-03-22 16:52 by i_cooler
[考研] 275求调剂 +6 shansx 2026-03-22 8/400 2026-03-22 15:27 by barlinike
[考研] 一志愿070300浙大化学358分，求调剂！ +3 酥酥鱼.. 2026-03-21 3/150 2026-03-22 11:31 by 杨杨杨紫
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-18 3/150 2026-03-21 17:31 by ColorlessPI
[考研] 266求调剂 +3 哇呼哼呼哼 2026-03-20 3/150 2026-03-21 16:46 by barlinike
[考研] 303求调剂 +5 睿08 2026-03-17 7/350 2026-03-21 03:11 by JourneyLucky
[考研] 材料专业求调剂 +6 hanamiko 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:24 by JourneyLucky
[考研] 288求调剂 +16 于海海海海 2026-03-19 16/800 2026-03-20 22:28 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 eation27 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:32 by JourneyLucky
[考研] 环境工程调剂 +9 大可digkids 2026-03-16 9/450 2026-03-20 17:38 by 醉在风里
[考研] 298-一志愿中国农业大学-求调剂 +9 手机用户 2026-03-17 9/450 2026-03-20 14:24 by 无懈可击111
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 本科郑州大学物理学院，一志愿华科070200学硕，346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:12 by ruiyingmiao
[考研] 考研调剂 +3 淇ya_~ 2026-03-17 5/250 2026-03-17 09:25 by Winj1e
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭