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shellyxss

金虫 (正式写手)

[求助] 提交基因组序列至NCBI

我向NCBI提交了基因组序列,对方回复了邮件,但是我不太明白下面这段话的意思:
If there are gaps in your sequence, do you know the order and orientation of the contigs and were able to assemble your sequences, with Ns between the contigs, into a single scaffold representing the genome with no extra unplaced contigs?
有没有比较了解的小伙伴帮忙解释一下啊?
感激不尽!
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yuman0709

铁虫 (初入文坛)

你的基因是不是有重叠基因?感觉像是说你传的基因没有组装好或排列好
2楼2015-12-22 13:24:13
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shellyxss

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuman0709 at 2015-12-22 13:24:13
你的基因是不是有重叠基因?感觉像是说你传的基因没有组装好或排列好

我的是公司给组装好的,应该没有重叠。
我感觉像是在说有gap啥的,但是具体不太明白什么意思。
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3楼2015-12-22 13:44:09
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品茗听雨0530

铁虫 (小有名气)

请问你的原始数据上传时是什么格式的?
4楼2015-12-22 22:15:54
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