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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 提交基因组序列至NCBI
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shellyxss

金虫 (正式写手)

[求助] 提交基因组序列至NCBI

我向NCBI提交了基因组序列，对方回复了邮件，但是我不太明白下面这段话的意思：
If there are gaps in your sequence, do you know the order and orientation of the contigs and were able to assemble your sequences, with Ns between the contigs, into a single scaffold representing the genome with no extra unplaced contigs?
有没有比较了解的小伙伴帮忙解释一下啊？
感激不尽！
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Always be curious about nature
1楼 2015-12-22 10:17:12
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yuman0709

铁虫 (初入文坛)
你的基因是不是有重叠基因?感觉像是说你传的基因没有组装好或排列好
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2楼2015-12-22 13:24:13
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shellyxss

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yuman0709 at 2015-12-22 13:24:13
你的基因是不是有重叠基因?感觉像是说你传的基因没有组装好或排列好

我的是公司给组装好的，应该没有重叠。
我感觉像是在说有gap啥的，但是具体不太明白什么意思。
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Always be curious about nature
3楼2015-12-22 13:44:09
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品茗听雨0530

铁虫 (小有名气)
请问你的原始数据上传时是什么格式的？
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4楼2015-12-22 22:15:54
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