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zhangxm1979

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 审稿人提的晶体结构的问题,怎么解决? 已有2人参与

Aromatic H atoms ill-defined
No evidence for H atoms at O6
No evidence for H atoms at N2 in (CH~3~)NH~2~
No evidence for methyl H atoms in (CH~3~)NH~2~
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匿名

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10楼2015-12-22 09:01:17
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zhangxm1979: 金币+10 2015-12-21 20:34:27
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2楼2015-12-21 11:18:14
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jackdeng

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【答案】应助回帖

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zhangxm1979: 金币+10 2015-12-21 20:46:11
芳环上的H应该用理论加氢,其他涉及到的原子上的H加的不正确,应该根据实际的情况加。
3楼2015-12-21 12:38:09
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zhangxm1979

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jackdeng at 2015-12-21 12:38:09
芳环上的H应该用理论加氢,其他涉及到的原子上的H加的不正确,应该根据实际的情况加。

谢谢!从哪里能看到氢加的有问题?
4楼2015-12-21 14:22:23
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zhangxm1979

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lich666 at 2015-12-21 11:18:14
这几个原子上加氢可能有错误,仔细检查下重新加把。

我还有个数据审稿人也提了些问题我修不好,你能否帮我修修,
1. Aromatic H atoms   ill-defined.    DMF molecule ill-edefined
No evidence for H atoms at O6 or O8 or H atom at O5
Maxima adjacent to Cd1 and Cd2.  Are the chemical types correct?
2. As pointed out previously, routine checks  show that the DMF and H~2~O of solvation lie on a mirror plane with half-occupancy.  However the anomalously large U~eq~ and U~ii~ values for O7,N3,C10.C11.C12 are entirely consistent with the occupancies of these sites less than the assigned 0.5 value.  Accordingly it is recommended that the refinement be redone while allowing a free-variable occupancy parameter to be refined for water O8 while another free-variable occupancy parameter is refined for the DMF molecule
最难的是第二个问题,你能帮我修修吗?
5楼2015-12-21 20:44:41
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匿名

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6楼2015-12-21 20:46:21
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zhangxm1979

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by lich666 at 2015-12-21 20:46:21
你得把结构发上来吧
...

非常感谢,

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7楼2015-12-21 21:00:16
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匿名

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zhangxm1979: 金币+30, ★★★★★最佳答案 2015-12-22 09:53:38
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8楼2015-12-21 22:05:38
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zhangxm1979

铁杆木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by lich666 at 2015-12-21 22:05:38
O8重新修了一下,DMF上氢重新加了一下。审稿人还说金属原子温度因子不正常,这个是硬伤,可能定错了。估计是吸收校正没做好,重新做下吧,如果不行只能重新收数据了。
http://pan.baidu.com/s/1i4nA1iX...

非常感谢,辛苦了!自由占有率修了吗?
9楼2015-12-22 08:22:56
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