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areslhr

铁虫 (小有名气)

[交流] 一个导致我做了20次PCR也没找到的问题 已有29人参与

LZ 在国外访问,做昆虫线粒体基因组的。
提完模板之后,扩增最简单的COX1基因,胶图如下
一个导致我做了20次PCR也没找到的问题

之后为了增加样本量,又提了两次也还好。后来突然有一次就开始出现拖带,并且不再出现原条带。而12S 基因扩增的很好,条带十分清晰。 为了查明是哪部分原因。
做了很多次PCR,可谓心力交瘁。
1.用了三台机器,排除机器原因。 2.更换premix,更换水,重新配置引物,无效果。 3.两种模板均出现此情况 4.作为negative,以水替代DNA的对照也出现同样的拖带。 5。12S可以稳定扩增。如图。

一个导致我做了20次PCR也没找到的问题-1

今天换了一种新的模板作为对照,更加诡异。拖带和条带同时存在,而原模板和水仍然无条带,仅有拖带。

一个导致我做了20次PCR也没找到的问题-2

我最不理解为什么新换的水里也有拖带,如有高手指教,不胜感激。

对不起我只有4.5个金币,还不能悬赏。

一个导致我做了20次PCR也没找到的问题-3
1.jpg


一个导致我做了20次PCR也没找到的问题-4
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一个导致我做了20次PCR也没找到的问题-5
601800125818983966.jpg
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Stop and stare
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areslhr

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
45楼: Originally posted by yglky at 2015-12-23 14:56:59
1、阴性对照也出现条带,说明污染PCR体系。这个很难找到哪个组分污染,建议彻底更换新的体系。
2、拖带现在可能有两个原因:模板量太大或者dNTP太多,模板量偏多是主要原因

其实我能换的都换了. 除了模板和枪,而且不太理解为什么没有模板的negative还能出来东西。

模板量太大不可能,当时所用DNA第一提取最开始有条带,现在是稀释10倍之后的版,条带消失了。

DNTP有一点点可能,因为最近枪出现了问题,会比正常值多抽出来一点。

唉。真的要哭了。
Stop and stare
50楼2015-12-23 21:24:00
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glove94

木虫 (小有名气)

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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-13 22:52:54
maker没有拖带,胶和缓冲液应该是没有问题的

发自小木虫Android客户端
2楼2015-12-19 00:51:44
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匿名

用户注销 (正式写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-13 22:52:40
本帖仅楼主可见
3楼2015-12-19 02:03:12
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areslhr

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by glove94 at 2015-12-19 00:51:44
maker没有拖带,胶和缓冲液应该是没有问题的

哎、是啊..我不知道怎么办好了
Stop and stare
4楼2015-12-19 18:39:43
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