| 查看: 1452 | 回复: 1 | |||
撒哈拉0705铁虫 (小有名气)
|
[求助]
黄杆菌属和假单胞菌属有什么亲缘关系吗？为什么测序之后同时比对出这两种菌 已有1人参与
|
|
黄杆菌属：Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium.、 假单胞菌属：Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Alteromonadales; Pseudoalteromonadaceae; Pseudoalteromonas. 明明是不同的们纲目科属啊，为什么一个菌比对的时候会同时比对出这两种呢？而且还都是100%，序列v3区，比对长度150bp，难道是因为序列太短了？望各位前辈指教 |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有269人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
haloarchaeon
金虫 (小有名气)
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 683
- 红花: 2
- 帖子: 70
- 在线: 27.6小时
- 虫号: 954250
- 注册: 2010-02-09
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
150bp的确太短了。 如果是分离的菌株，建议用引物27F和1541r测菌株的16SrRNA基因，再比对。 一般菌株用BLAST就可以比对。但要计算具体的相似性，建议用EzTaxon（http://www.ezbiocloud.net/eztaxon/database）。 |
2楼2015-12-18 19:49:48
