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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 怎么将配体和蛋白整合为一个复合物
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llllcccc5642

铜虫 (初入文坛)

[求助] 怎么将配体和蛋白整合为一个复合物 已有5人参与

我用autodock vina做酶和配体的对接，最终生成了两个pdb文件，请问如何将将配体和蛋白整合为一个复合物，用pymol可以实现吗
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hh
1楼 2015-12-17 19:43:14
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
pymol可以实现啊，选择好构象和蛋白一块保存即可
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2楼2015-12-18 16:42:37
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生物小E

新虫 (初入文坛)
可以的，我也正在尝试

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3楼2015-12-21 13:46:36
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benniu2004

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

直接在写字板里粘在一起不行么？我一直是这么做的。

发自小木虫IOS客户端
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4楼2015-12-22 06:52:27
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sky-GD

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

亲，这个问题你已经解决了吗？我也想问同样的问题，我是做了对接之后，想做ligplot，但是要求配体受体在一个pdb中，不会做，555555555555
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5楼2016-10-31 19:29:54
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changjun

铜虫 (著名写手)
好做啊。

发自小木虫Android客户端
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天然产物、药物开发
6楼2016-11-01 10:48:41
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changjun

铜虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by sky-GD at 2016-10-31 19:29:54
亲，这个问题你已经解决了吗？我也想问同样的问题，我是做了对接之后，想做ligplot，但是要求配体受体在一个pdb中，不会做，555555555555

看我的回贴，在一个相同的问题里我给出了方法。

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天然产物、药物开发
7楼2016-11-01 10:49:58
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ULYSSEESWB

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

合并语句
create A_B, A B
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8楼2016-12-27 11:14:40
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