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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 【求助】分子能量的问题
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

[交流] 【求助】分子能量的问题

我用insightII计算的小分子能量都在“百”数量级，像下面这个是依那普利的（最低能量构象）：
Summary for object: LOWEST EAL with cutoff = 100.00000 angstroms
  Van der Waals energy =          38.67318 kcal
     repulsive energy =           99.01383 kcal
     dispersive energy =         -60.34065 kcal
  Coulomb energy =                48.29597 kcal
  Bond energy =                   13.71381 kcal
  Theta energy =                  13.72788 kcal
  Phi energy =                     4.72919 kcal
  Out of plane energy =            0.02381 kcal
  Bond-bond energy =               0.00000 kcal
  Bond-theta energy =              0.00000 kcal
  Theta-theta energy =             0.00000 kcal
  Theta-theta-phi energy =         0.00000 kcal
  Bond-bond(1-3) energy =          0.00000 kcal
  Op-op energy =                   0.00000 kcal
  Phi-phi energy =                 0.00000 kcal
  Hydrogen-bond energy =           0.00000 kcal
Total energy =                   119.16384 kcal
Maximum derivatives (kcal/mole-Angstrom):
    dE/dx = 0.00006    dE/dy = 0.00005    dE/dz = -0.0000
这里显示其能量为119，与活性构象（290）的差值约为170kcal/mol，我算了好多其它的小分子也是这种情况。而文献里，sybyl，catalyst经我询问，其小分子能量都只是十几kcal/mol而已，差值就更小了。insightII怎么这么高啊？
请帮忙看看啊！感激不尽
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1楼 2008-09-22 21:06:00
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
帮忙啊，自己顶下！
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个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
2楼2008-09-24 11:20:55
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