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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

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[交流] 【求助】分子能量的问题

我用insightII计算的小分子能量都在“百”数量级，像下面这个是依那普利的（最低能量构象）：
Summary for object: LOWEST EAL with cutoff = 100.00000 angstroms
  Van der Waals energy =       38.67318 kcal
   repulsive energy =          99.01383 kcal
   dispersive energy =       -60.34065 kcal
  Coulomb energy =             48.29597 kcal
  Bond energy =                13.71381 kcal
  Theta energy =                13.72788 kcal
  Phi energy =                   4.72919 kcal
  Out of plane energy =          0.02381 kcal
  Bond-bond energy =             0.00000 kcal
  Bond-theta energy =             0.00000 kcal
  Theta-theta energy =          0.00000 kcal
  Theta-theta-phi energy =       0.00000 kcal
  Bond-bond(1-3) energy =       0.00000 kcal
  Op-op energy =                0.00000 kcal
  Phi-phi energy =                0.00000 kcal
  Hydrogen-bond energy =          0.00000 kcal
Total energy =                119.16384 kcal
Maximum derivatives (kcal/mole-Angstrom):
dE/dx = 0.00006 dE/dy = 0.00005 dE/dz = -0.0000
这里显示其能量为119，与活性构象（290）的差值约为170kcal/mol，我算了好多其它的小分子也是这种情况。而文献里，sybyl，catalyst经我询问，其小分子能量都只是十几kcal/mol而已，差值就更小了。insightII怎么这么高啊？
请帮忙看看啊！感激不尽

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