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changjiang77

金虫 (正式写手)

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虫号: 510333
注册: 2008-02-24
专业: 电化学分析

[交流] 【求助】想把分子放进晶格。。。

各位高人，大侠，过客，我在做MS分子晶体的模拟。想把一些现成的分子试着组成不同的晶体结构。比如对苯二甲酸，我把它的分子画好，现在想直观的放在不同的晶格中。不知有什么好办法能很方便的放进去，而不用一个一个原子的输入位置参数。还能方便的手动改变分子空间取向而不需要再次重新建立晶格。
万分感谢。

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-25 at 19:30 ]

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1楼 2008-09-21 12:44:25

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

solarman

新虫 (正式写手)

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虫号: 599917
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专业: 凝聚态物性 II ：电子结构

★
gromacs(金币+1,VIP+0):谢谢指点

引用回帖:

Originally posted by changjiang77 at 2008-9-21 23:07:
先谢谢2楼,果然自有高人在.
我先建了一个立方晶格, 然后把分子贴进去了。但是不知为什么，分子和晶格不能相对位置调整。本人仍属菜鸟级，还请高人指点。

[ Last edited by changjiang77 on 2008-9-21 at 23: ...

把分子贴进去之前，你可以先改动晶格的原点位置，相当于进行了相对位置调整