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changjiang77

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】 想把分子放进晶格。。。

各位高人,大侠,过客,我在做MS分子晶体的模拟。想把一些现成的分子试着组成不同的晶体结构。比如对苯二甲酸,我把它的分子画好,现在想直观的放在不同的晶格中。不知有什么好办法能很方便的放进去,而不用一个一个原子的输入位置参数。还能方便的手动改变分子空间取向而不需要再次重新建立晶格。
  万分感谢。

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-25 at 19:30 ]
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wobuzhidao1

金虫 (小有名气)

根据我做分子晶体的经验,目前针对分子晶体好像主要采用的是画分子结构,而后paste进去的,但是面临着两个问题:1、晶胞中间好像自动给出了应该有几个的分子,比如空间对称性问题,你放置一个分子自动对称的给出了几个,到底对不对?2、楼主反映的位置问题,你手动调整能够保证原子位置都在应该的位置上吗?所以说,分子晶体构建完后,你的可靠性值得斟酌。离子晶体当然不存在这个问题,就不说了。
8楼2008-09-28 12:06:17
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