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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » MoS2二维层状如何优化？老是不收敛
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟

[求助] MoS2二维层状如何优化？老是不收敛 已有3人参与

如题，MoS2二维层状材料如何结构优化。ISIF=3？但真空层厚度会变。ISIF=3 只优化xy方向？固定z方向，谢谢
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1楼 2015-12-04 07:47:39
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小虫虫LG

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 08:17:59
设定isif=4即可
不放心就自己手动优化，结果差不多的
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2楼2015-12-04 08:29:15
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小虫虫LG at 2015-12-04 08:29:15
设定isif=4即可
不放心就自己手动优化，结果差不多的

ISIF=4是固定体积，对于理论计算，是不是应该全部放开ISIF=3，麻烦进一步指点下，谢谢
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3楼2015-12-04 20:54:05
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小虫虫LG

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by calos818 at 2015-12-04 20:54:05
ISIF=4是固定体积，对于理论计算，是不是应该全部放开ISIF=3，麻烦进一步指点下，谢谢...

你试试就知道效果
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4楼2015-12-04 22:10:00
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小虫虫LG at 2015-12-04 22:10:00
你试试就知道效果...

好的
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5楼2015-12-04 22:18:01
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一川烟草

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 15:09:56
好像要加vdm修正
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6楼2015-12-05 09:32:57
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西风月123

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-05 15:10:01
我尝试过单层MoS2的优化，我一般也设置ISIF=3,也就是全部放开。在优化的过程中，若出现不断吃掉真空层，我就先将POTIM调小。我觉得可能是POTIM步长太大，总会越过能量最低的那个最优位置。如果还不行，可以考虑更换下IBRION从2变成1，这样换种方法来找最优值。如果还不行，可以将最初的模型的晶格常数微调一下。
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7楼2015-12-05 09:35:31
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
引用回帖:
7楼: Originally posted by 西风月123 at 2015-12-05 09:35:31
我尝试过单层MoS2的优化，我一般也设置ISIF=3,也就是全部放开。在优化的过程中，若出现不断吃掉真空层，我就先将POTIM调小。我觉得可能是POTIM步长太大，总会越过能量最低的那个最优位置。如果还不行，可以考虑更换 ...

谢谢，我也是发现ISIF=3会吃掉真空层，这样就不明白文献上说的真空厚度15埃啥意思。另外，吃掉真空后，再算性质时（ISIF=2）真空是否要变回15埃？搞不懂到底是正确的优化和电子结构计算
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8楼2015-12-05 16:58:31
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西风月123

木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by calos818 at 2015-12-05 16:58:31
谢谢，我也是发现ISIF=3会吃掉真空层，这样就不明白文献上说的真空厚度15埃啥意思。另外，吃掉真空后，再算性质时（ISIF=2）真空是否要变回15埃？搞不懂到底是正确的优化和电子结构计算...

我也纠结过这个问题，我自己的理解呀，在建模的时候最初设置了15A的真空层，但是，很多时候最初建的结构还是比较理想的，优化后不会发生太大的变化（而且一般超过10A之上，真空层对体系的影响差别不大了），这样是不是可以近似认为真空层还是原来的15A呢？或者笼统地说，体系加了15A的真空层。（其实实际的真空层厚度，优化后，用C轴的总高度，减去最顶部和最底部的原子的距离差是可以得到的，对不？这才是准确的）

不知道我说的对不对呀？希望指正呀，谢谢。
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9楼2015-12-05 19:44:00
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
引用回帖:
6楼: Originally posted by 一川烟草 at 2015-12-05 09:32:57
好像要加vdm修正

我看文献上一般对于单层都没说加vdm甚至不加SOC。vdm不是层之间才考虑么。单层需要么？刚接触，不太懂
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10楼2015-12-05 19:46:32
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