| 查看: 1195 | 回复: 2 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
求问各位大神，怎么将两条建好的蛋白链拼在一起形成异源二聚体啊？？？ 已有1人参与
|
||
|
我用modeller建了两条蛋白链，但是现在遇到了问题，就是要怎么把两条链拼在一起形成异源二聚体呢？在modeller脚本有看到 from modeller import * from modeller.automodel import * # Load the automodel class log.verbose() class MyModel(automodel): def special_patches(self, aln): # Rename both chains and renumber the residues in each self.rename_segments(segment_ids=['X', 'Y'], renumber_residues=[1, 1]) # Another way to label individual chains: self.chains[0].name = 'X' self.chains[1].name = 'Y' def special_restraints(self, aln): rsr = self.restraints at = self.atoms # Restrain the specified CB-CB distance to 8 angstroms (st. dev.=0.1) # Use a harmonic potential and X-Y distance group. # Note that because special_patches is called before special_restraints, # we must use the relabeled chain IDs and residue numbers here. rsr.add(forms.gaussian(group=physical.xy_distance, feature=features.distance(at[CB:40:Y], at['CB:71:Y']), mean=8.0, stdev=0.1)) 这个脚本中指明是Y链的两个β碳原子，那两条链之间的距离还是没有说明，是吧？求各位大神指点迷津啊 |
回复此楼» 猜你喜欢
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有3人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有3人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有3人回复
3楼2017-04-27 14:02:08
