| 查看: 1145 | 回复: 2 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
求问各位大神,怎么将两条建好的蛋白链拼在一起形成异源二聚体啊??? 已有1人参与
|
||
|
我用modeller建了两条蛋白链,但是现在遇到了问题,就是要怎么把两条链拼在一起形成异源二聚体呢?在modeller脚本有看到 from modeller import * from modeller.automodel import * # Load the automodel class log.verbose() class MyModel(automodel): def special_patches(self, aln): # Rename both chains and renumber the residues in each self.rename_segments(segment_ids=['X', 'Y'], renumber_residues=[1, 1]) # Another way to label individual chains: self.chains[0].name = 'X' self.chains[1].name = 'Y' def special_restraints(self, aln): rsr = self.restraints at = self.atoms # Restrain the specified CB-CB distance to 8 angstroms (st. dev.=0.1) # Use a harmonic potential and X-Y distance group. # Note that because special_patches is called before special_restraints, # we must use the relabeled chain IDs and residue numbers here. rsr.add(forms.gaussian(group=physical.xy_distance, feature=features.distance(at[CB:40:Y], at['CB:71:Y']), mean=8.0, stdev=0.1)) 这个脚本中指明是Y链的两个β碳原子,那两条链之间的距离还是没有说明,是吧?求各位大神指点迷津啊 |
» 猜你喜欢
课题组招2027级博士 上海工程技术大学 激光智能制造方向
已经有4人回复
现代”学阀”该如何界定
已经有8人回复
上海工程技术大学 激光智能制造课题组 2027级博士研究生招生
已经有3人回复
实名举报:华南理工大学物理与光电学院副院长李志远婚内两次出轨女学生(博士)
已经有16人回复
上海工程技术大学激光智能制造课题组|2027级博士研究生招生公告
已经有11人回复
上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生
已经有10人回复
申博发邮件
已经有11人回复
各位大神,目前国内有哪些比较好用的逆合成软件?
已经有12人回复
我的奶奶
已经有3人回复
国社科系统bug了,是不是要放榜了?
已经有9人回复
3楼2017-04-27 14:02:08










回复此楼