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a344902006

新虫 (初入文坛)

[求助] GUASSIAN中遇到的一点语法问题。 已有1人参与

输入中每个原子都有(PDBNAME=X,RESNAME=X,RESNUM=X),
然后运行就有语法错误,把它们删掉后,就可以正常运行,为什么呢?
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
PDB文件参数
有一些附加项可以与核参数和/或片段一起定义。这些项与PDB文件一起使用,用于保留其中包含的残基以及其它结构信息,这样用户无需再作定义。但是,你可能会在GaussView用源自PDB文件的结构创建的Gaussian 09输入文件中看到它们。
RESNum指定原子所位于的残基。该值的格式为n[X[Y]],其中n是一个整数(未必为正),
X是一个可选的单个字符插入代码,是可选的链字母。如果定义了链但没有插入代码,
那么X可以是下划线:ResNum=-17_C用于链C上编号为-17的残基。
RESName指定三个字符的残基名。
PDBName如果不是元素名的话,指定赋值给原子的名称。
摘自高斯手册。至于你说的情况,没有输入文件,不好判断。
2楼2015-11-24 06:57:03
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