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a344902006新虫 (初入文坛)
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[求助]
GUASSIAN中遇到的一点语法问题。 已有1人参与
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输入中每个原子都有（PDBNAME=X,RESNAME=X,RESNUM=X）， 然后运行就有语法错误，把它们删掉后，就可以正常运行，为什么呢？ |
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 八龙尊者 |
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木虫 (著名写手)
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- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
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PDB文件参数 有一些附加项可以与核参数和/或片段一起定义。这些项与PDB文件一起使用，用于保留其中包含的残基以及其它结构信息，这样用户无需再作定义。但是，你可能会在GaussView用源自PDB文件的结构创建的Gaussian 09输入文件中看到它们。 RESNum指定原子所位于的残基。该值的格式为n[X[Y]]，其中n是一个整数（未必为正）， X是一个可选的单个字符插入代码，是可选的链字母。如果定义了链但没有插入代码， 那么X可以是下划线：ResNum=-17_C用于链C上编号为-17的残基。 RESName指定三个字符的残基名。 PDBName如果不是元素名的话，指定赋值给原子的名称。 摘自高斯手册。至于你说的情况，没有输入文件，不好判断。 |
2楼2015-11-24 06:57:03