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zhy0512

新虫 (初入文坛)


[交流] 对相关势函数求原子受力

已知各原子的三维坐标,对二体势(例如Morse势)求原子受力,可直接用势函数对位移求导。但三体势(例如键角能)如何求个原子受力?
查了好久文献资料都没找到相关内容,还希望各位前辈指教。
若有相关的文献和书籍,还望推荐。万分感谢。

对相关势函数求原子受力


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jjlex

木虫 (正式写手)



zhy0512(金币+1): 谢谢参与
cos(theta)=向量a.向量b/|ab|,链式求导一直求到每个原子的xyz坐标

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2楼2015-11-23 12:04:00
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jjlex

木虫 (正式写手)


向量a=向量i->j
向量b=向量i->k

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4楼2015-11-23 12:06:30
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zhuguiqiu

禁虫 (文坛精英)

本帖内容被屏蔽

23楼2015-11-23 12:39:16
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个的公式有点复杂, 你自己可以推导出来. 如果自己推导不出来, 你可以找些分子动力学程序的源代码看看, 里面会有相应的计算代码.

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24楼2015-11-24 00:34:38
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zhy0512

新虫 (初入文坛)


送红花一朵
引用回帖:
24楼: Originally posted by jerkwin at 2015-11-24 00:34:38
这个的公式有点复杂, 你自己可以推导出来. 如果自己推导不出来, 你可以找些分子动力学程序的源代码看看, 里面会有相应的计算代码.

谢谢。还想请教一下。
公式推导是将cos用余弦公式展开,然后再用链式求导吗?
对相关势函数求原子受力-1



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25楼2015-11-24 13:33:14
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
25楼: Originally posted by zhy0512 at 2015-11-24 13:33:14
谢谢。还想请教一下。
公式推导是将cos用余弦公式展开,然后再用链式求导吗?

...

仔细看看下面的注释吧
!  i<---j--->k    Tht = Ang(i j k)
!  E = E(Tht), Rji*Rjk*cosTht = Dot(rji, rjk) = Xi*Xk+Yi*Yk+Zi*Zk
!  Rjk*gradi[Rji*cosTht] = gradi[Xi*Xk+Yi*Yk+Zi*Zk]
!  cosTht*gradi[Rji]-Rji*sinTht*gradi[Tht] = ^rjk
! -Rji*sinTht*gradi[Tht] = ^rjk - cosTht ^rji
!  gradi[Tht] = -(^rjk - cosTht ^rji)/(Rji*sinTht)

!  Fi = -gradi E(Tht) = -{ dE/dXi, dE/dYi, dE/dZi }
!     = -dE/dTht gradi[Tht]
!     = dE/dTht (^rjk - cosTht ^rji)/(Rji*sinTht)
!  Fk = dE/dTht (^rji - cosTht ^rjk)/(Rjk*sinTht)
!  Fj = -Fi-Fk
26楼2015-11-24 21:17:27
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syhorchid3楼
2015-11-23 12:05   回复  
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dmbb5楼
2015-11-23 12:28   回复  
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vrxcyvkss18楼
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