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小马儿ing

新虫 (小有名气)

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专业: 细胞生物学研究中的新方法

[求助] 有在nature上一篇关于生物信息学的文章中的几个图，看不明白，希望得到帮助，谢谢已有1人参与

一篇关于生物信息学的文章，题名为Inferring ancient divergences requires genes with strong phylogenetic signals，本人没有相关的学习背景，对此很是迷茫，以下是文章中出现的图，希望得到大家的指点

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有在nature上一篇关于生物信息学的文章中的几个图，看不明白，希望得到帮助，谢谢-1

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有在nature上一篇关于生物信息学的文章中的几个图，看不明白，希望得到帮助，谢谢-2

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1楼 2015-11-22 19:50:31

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雨中的雕塑

银虫 (小有名气)

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性别: GG
专业: 动物系统及分类学

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

人家这个文章涉及到的这个内容太深了，这篇文章应该是方法论的文章，对进化生物学应该非常有意义（毋庸置疑，nature的文章都是非常值得拜读的），这篇文章是讲的当前系统发育研究中一个重要的问题，就是构建系统发育关系的序列信息应该选择那些基因，那些基因用于做序列maker是最恰当的，从原始的形态特征的相似度，人们就开始研究物种之间的关系，90年代的分子技术高速发展，给系统发育研究提供了新的材料，研究者不只局限于形态特征的相似，更注重DNA maker的比对，从而构建稳定的系统发育关系，也就是基因树，但是基因树与真实的物种树其实是有差别的，要想建立更准确的物种树，探究物种之间的分歧关系，那就必须要选择合适的DNA maker作为材料，那什么DNA maker是合适的，那就是这些基因必须具有较强的遗传发育信号。举个列子，人、猩猩和狗，我们都知道人跟猩猩的亲缘关系显然比狗近，我们从形态特征上能够分辨这是我们的直观感受，用DNA maker去构建他们之间的关系，那么这个DNA maker应该选择哪个，哪个更含有人和猩猩亲缘关系近和狗关系远的DNA squence。这边文章从题目上看就是为了解决这一问题的，这么文章应该是比较了不同的DNA squence然后通过分析，选择出具有遗传效力的squence。具体的可搜索维基百科（英文版），phylogenetic signal，应该会有相关的知识去了解。