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woshisheia金虫 (初入文坛)
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Autodock结果分析求助 已有1人参与
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| dock的结果里面，为什么蛋白里面本来没有H原子的N原子上出现了H原子，而且还有一个N原子上的H原子和小分子上的O原子之间形成了氢键，这个结果合理吗？在描述结果的时候，是否可以这样描述：小分子的O原子和蛋白上的N原子之间形成了氢键？ |
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2楼2015-11-25 16:11:20
waltq
木虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
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- 在线: 607小时
- 虫号: 47915
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- 性别: GG
- 专业: 发育生物学与生殖生物学
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楼主，我也在学习分子对接，好不容易走到autodock这一步，但是dlg文件又打不开，出现下面的问题，看了半天不知所云。望楼主指点一下。另外，我的系统是32位win7。 IDLE 1.2.2 ==== No Subprocess ==== >>> exception in _buildInputLig ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit d.readDlg(dlgFile) File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\AutoDockTools\Docking.py", line 105, in readDlg self.ch = ConformationHandler(self.ligMol, AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' Exception in Tkinter callback Traceback (most recent call last): File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\lib-tk\Tkinter.py", line 1403, in __call__ return self.func(*args) File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 5482, in guiCallback if hasattr(d.ligMol, 'vina_energy'): AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' |
3楼2016-03-04 17:12:00
