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金虫 (小有名气)

[求助] 怎样获得基因全长, 已有1人参与

怎样知道在NCBI上查到的是基因全长,包含启动子的。如果找不到请问用哪种方法可以扩的基因的全长,包括启动子。先谢谢啦。
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15836073150

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2015-11-22 12:29:25
是不是全长,是否包含启动子序列,genebank格式信息中都可以查到。如果有编码区,没有启动子,那就用TAIL-PCR法扩编码区之前的启动子区,如果编码区也没有,那就用同源克隆法先扩编码区核心序列,然后RACE法扩cDNA全 ...

我现在有启动子和部分CDS,现在应该怎么做那。非常谢谢。

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4楼2015-11-22 16:44:59
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liukai123

新虫 (小有名气)

如果知道基因的名称,或者登录号,可以直接搜,如果是定位,那你就要找到连锁的marker,在里面blast搜,选择genebank模式,就可以看到详细的注释,包括编码区和非编码区,还有详细的文章都可以找到。

发自小木虫Android客户端
2楼2015-11-21 23:02:39
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
是不是全长,是否包含启动子序列,genebank格式信息中都可以查到。如果有编码区,没有启动子,那就用TAIL-PCR法扩编码区之前的启动子区,如果编码区也没有,那就用同源克隆法先扩编码区核心序列,然后RACE法扩cDNA全长,设计特异引物扩基因全长,再TAIL-PCR扩启动子。
3楼2015-11-22 12:29:25
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15836073150

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liukai123 at 2015-11-21 23:02:39
如果知道基因的名称,或者登录号,可以直接搜,如果是定位,那你就要找到连锁的marker,在里面blast搜,选择genebank模式,就可以看到详细的注释,包括编码区和非编码区,还有详细的文章都可以找到。
...

非常谢谢,

发自小木虫Android客户端
5楼2015-11-22 16:45:29
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