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15836073150

金虫 (小有名气)

[求助] 怎样获得基因全长， 已有1人参与

怎样知道在NCBI上查到的是基因全长，包含启动子的。如果找不到请问用哪种方法可以扩的基因的全长，包括启动子。先谢谢啦。
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1楼 2015-11-21 17:57:18
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liukai123

新虫 (小有名气)
如果知道基因的名称，或者登录号，可以直接搜，如果是定位，那你就要找到连锁的marker，在里面blast搜，选择genebank模式，就可以看到详细的注释，包括编码区和非编码区，还有详细的文章都可以找到。

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2楼2015-11-21 23:02:39
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
是不是全长，是否包含启动子序列，genebank格式信息中都可以查到。如果有编码区，没有启动子，那就用TAIL-PCR法扩编码区之前的启动子区，如果编码区也没有，那就用同源克隆法先扩编码区核心序列，然后RACE法扩cDNA全长，设计特异引物扩基因全长，再TAIL-PCR扩启动子。
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3楼2015-11-22 12:29:25
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15836073150

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2015-11-22 12:29:25
是不是全长，是否包含启动子序列，genebank格式信息中都可以查到。如果有编码区，没有启动子，那就用TAIL-PCR法扩编码区之前的启动子区，如果编码区也没有，那就用同源克隆法先扩编码区核心序列，然后RACE法扩cDNA全 ...

我现在有启动子和部分CDS，现在应该怎么做那。非常谢谢。

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4楼2015-11-22 16:44:59
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15836073150

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liukai123 at 2015-11-21 23:02:39
如果知道基因的名称，或者登录号，可以直接搜，如果是定位，那你就要找到连锁的marker，在里面blast搜，选择genebank模式，就可以看到详细的注释，包括编码区和非编码区，还有详细的文章都可以找到。
...

非常谢谢，

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5楼2015-11-22 16:45:29
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 15836073150 at 2015-11-22 16:44:59
我现在有启动子和部分CDS，现在应该怎么做那。非常谢谢。
...

那就做染色体步移，也就是TAIL-PCR往基因3‘段延伸。
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

15836073150
6楼2015-11-22 20:32:50
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15836073150

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by stone2239 at 2015-11-22 20:32:50
那就做染色体步移，也就是TAIL-PCR往基因3‘段延伸。...

嗯嗯，非常谢谢您。

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7楼2015-11-23 09:00:03
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