应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 新药研发 » 资料求助 » MOE全新药物分子设计，请赐教！
51/1返回列表
查看: 1622  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

小力xiaoli

铜虫 (初入文坛)

[求助] MOE全新药物分子设计，请赐教！

用MOE做全新药物设计，有些问题不太明白：1，在fragments模块的scaffold R replacement中，OK后弹出vectors of wrong length，为啥？而将scoring 改成NONE后又会有些片段生成。。。2， fragment模块是将数据库中保存的整个片段对接到口袋部位？还是有连接不同片段或具有生长的功能？ 3，另外，打开的蛋白配体复合物，其Electrostatic Map 显示的口袋的信息会根据不同的配体而变化吗？还是因为口袋有伸缩的功能或和配体相互作用后引起氨基酸位置等变化？HELP中的教程好像不全，各位有好的教程，望指教！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
开心做自己
1楼 2015-11-20 15:21:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枫叶留殇

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小力xiaoli at 2015-12-07 10:07:29
差不多明白了

楼主，您好。最近我也刚开始学MOE，有几个问题想向您请教。我现在已经有了片段化合物与蛋白的复合物结构，我想对片段进行后续优化，不知道该怎么进行，烦请楼主赐教。
我的想法是：（1）直接在接触界面对分子添加Build，然后minize,找出能提高affinity的分子。这样盲目性比较大，而且我想知道添加Build模块后，软件会不会进行蛋白+化合物的整体能量计算？（2）利用compute里面的fragment板块，可以进行片段生长，这里我的问题是，如何让分子生长到口袋里去，而不是随机延伸。因为不专业，问的可能有问题。如果楼主有更好的建议或者操作方法，将不胜感激。期待您的回复。
赞一下 回复此楼
在冲往未来的道路上，我会全力以赴~~~
3楼2018-06-11 16:47:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答
查看全部 3 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 284求调剂 +10 Zhao anqi 2026-03-22 10/500 2026-03-24 00:08 by Equinoxhua
[考研] 一志愿吉大化学322求调剂 +3 17501029541 2026-03-23 4/200 2026-03-23 23:47 by Txy@872106
[考研] 材料专硕找调剂 +3 哈哈哈吼吼吼哈 2026-03-23 3/150 2026-03-23 23:13 by peike
[考研] 材料/农业专业，07/08开头均可，过线就行 +3 呵唔哦豁 2026-03-23 4/200 2026-03-23 22:30 by 汪！？！
[考研] 一志愿211 初试270分 求调剂 +4 谷雨上岸 2026-03-23 5/250 2026-03-23 21:18 by 不惑可乐
[考研] 工科0856求调剂 +5 沐析汀汀 2026-03-21 5/250 2026-03-23 17:56 by 海瑟薇-
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-17 10/500 2026-03-23 13:05 by 醉在风里
[考研] 070300，一志愿北航320求调剂 +3 Jerry0216 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:16 by 。。堂堂
[考研] 寻找调剂 +4 倔强芒? 2026-03-21 4/200 2026-03-22 16:14 by 木托莫露露
[考研] 0703化学297求调剂 +3 Daisy☆ 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:45 by ColorlessPI
[考研] 311求调剂 +3 勇敢的小吴 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:40 by ColorlessPI
[考研] 南昌大学材料专硕311分求调剂 +6 77chaselx 2026-03-20 6/300 2026-03-21 07:24 by JourneyLucky
[考研] 初始318分求调剂（有工作经验） +3 1911236844 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:33 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武理材料305分求调剂 +6 想上岸的鲤鱼 2026-03-18 7/350 2026-03-21 01:03 by JourneyLucky
[考研] 296求调剂 +6 www_q 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:56 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂 +8 小材化本科 2026-03-18 8/400 2026-03-20 23:16 by JourneyLucky
[考研] 317求调剂 +5 申子申申 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:26 by JourneyLucky
[考研] 086500 325 求调剂 +3 领带小熊 2026-03-19 3/150 2026-03-20 18:38 by 尽舜尧1
[考研] 本科郑州大学物理学院，一志愿华科070200学硕，346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭