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玄泷sunny

金虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学MD计算

最近我用DS3.0(windows版)计算MD,计算时间设置为3ns,现在已经运行了150多个小时还没有结束,一直停在done这个状态,已经有26个小时了,不知道是怎么回事,按照以前的话,出现Done后很快就会结束。计算的体系有点大,加完溶剂化之后有32620个原子,结果的保存频率为1PS保存一帧,现在电脑的CPU占用很少,1或者0。麻烦用DS软件或了解这方面计算的大神指导一下,万分感谢了!
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