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qjc830401

荣誉版主 (著名写手)

Chem.Q

[交流] 求助关于晶体中含有水分子的问题

在用Shelxtl处理单晶时,在xshell里面显示的是半个水分子,但是在XP处理的时候就显示2个水分子,不知道哪里出错了 ,请大家帮忙解决一下。
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http://www.pet2008.cn/index.php?fromuid=11277
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haru007

木虫 (著名写手)

我也想知道

那位 大侠解答一下
谢了
2楼2008-09-15 10:08:13
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qjc830401

荣誉版主 (著名写手)

Chem.Q

XDJM  幫幫忙了啊
http://www.pet2008.cn/index.php?fromuid=11277
3楼2008-09-15 15:34:11
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

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qjc830401(金币+10,VIP+0):我想知道 :怎么该才可以在XP里面显示的是半个水分子,在CIF里面 也只是这半个水的信息,【现在CIF里面显示的是2个水的信息 】 谢谢了
给你短信回复了, 不知道是不是你要的答案.
xi2004-emuch@163.com
4楼2008-09-15 15:46:59
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qjc830401

荣誉版主 (著名写手)

Chem.Q

我想知道 :怎么该才可以在XP里面显示的是半个水分子,在CIF里面 也只是这半个水的信息,【现在CIF里面显示的是2个水的信息 】

希望LS 帮忙解决一下
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5楼2008-09-15 15:50:17
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

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qjc830401(金币+70,VIP+0):看来真的很麻烦啊 但是还是谢谢兄弟
XP画图时必须显示两个水啊. 但在文中要说明这两个水是在特殊位置.

你这个结构, 空间群是R-3,
而OW1是在 6c, 即 SOF为1/3 的位置.
  OW2是在3a,  即 SOF 为1/6的位置.

加起来就是1/3+1/6 =0.5 即半个水了.

所以, 画图时是要画出两个水, OW1, OW2, 虽然因为他们在特殊位置, 其占有率分别只有1/3和1/6.

所以XP画图和CIF一点也不矛盾.

倒是你现在两个水的温度因子太大, 氢加的对不对也难说. CIF check恐怕通不过.
xi2004-emuch@163.com
6楼2008-09-15 15:56:32
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qjc830401

荣誉版主 (著名写手)

Chem.Q

H 是一个老师加的 应该是对的

这个就没有办法补救了吗?
http://www.pet2008.cn/index.php?fromuid=11277
7楼2008-09-15 16:03:21
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

重新精修, 或许可以改进.


但最终应是多少水, 要看EA等信息.
xi2004-emuch@163.com
8楼2008-09-15 16:06:25
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qjc830401

荣誉版主 (著名写手)

Chem.Q

重新精修的时候 不知道怎么回事 要将水kill掉才可以精修  但是CIF里面显示的还是半个水

但是检测CIF的时候 会有一个B类错误 :说少分子  

这个会不会是 :在最开始精修的时候就有问题啊?
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9楼2008-09-15 16:10:35
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

CIF显示的水的多少, 是你给的分子式决定的,
就是
SFAC C H N O F
UNIT 234 270 54 27 54

这两行以及空间群决定的.
你把两个水删掉了, 可是你给的分子式并没有变, 当然CIF还是显示半个水了.
xi2004-emuch@163.com
10楼2008-09-15 16:13:32
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