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xd200620940铜虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】分子结构优化、能量最小化命令输入
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我对gaussian计算不太了解，现在要做个分子的结构优化和能量优化，不知道该如何输入命令，准备用半经验PM3来做，请告诉我输入命令，谢谢！ 另：做了优化后如何知道是分子结构已经是最低能量构象呢？ |
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4楼2008-09-14 11:10:38
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xd200620940(金币+3,VIP+0):谢谢！
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
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%mem=600MB '你要求内存 %chk=pm3.chk 'chk文件名 %nproc=2 '使用CPU 数目 ，只有linex有效 #p pm3 opt '任务参数 opt 结构优化 assfsfsfs ‘任务名称 0 1 ’总电荷 自旋多重度，下面开始是分子坐标 O 0.001 0.002 0.003 X Y Z H ... ... ... N ... ... ... ... ======================= 输出看到一句格言，就表示正常结束。 PM3 能量在输出文件中显示如下（其后是偶极矩的x，y，z 分量）： Energy= -.080731473251 NIter= 10. Dipole moment= .000000 .000000 -.739540 ======================== 找最小，做个频率分析(如果算得动的话)。关键字 freq ，没有虚频即可 [ Last edited by spkeey on 2008-9-14 at 11:11 ] |
2楼2008-09-14 10:48:27
xd200620940
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3楼2008-09-14 11:06:20