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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 关于iTRAQ蛋白质相对定量的一些疑问
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18116196449

新虫 (初入文坛)

[交流] 关于iTRAQ蛋白质相对定量的一些疑问 已有3人参与

对于取同等量的蛋白样品进行每个通路的iTRAQ标记。再将标记样品等量的混合-分级之后，MS/MS的结果，如何去确定差异蛋白是否上调或者下调？一直不太明白该相对定量是个什么情况。倘若1样中总共含有ABCDE中蛋白，50g的蛋白中分别表达10g，2样中因为某种原因导致A蛋白分泌增加A15g其他都保持不变。按照去同等量蛋白标记的原理，计算出来的A蛋白上调应该不是1.5.不太清楚其中的相对定量是一个什么样的概念。有哪位大神能解心中疑惑。
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1楼 2015-11-12 22:14:05
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馒头爱生物

银虫 (小有名气)
★
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的确不是1.5，因为iTRAQ每个样本上样量一致，你这一个样本50g，一个样本55g，需要先做归一化处理，倍数应该是1.5/1.1
不知道这样讲你明白了吗？
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2楼2015-11-18 16:07:31
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lys1906

禁虫 (初入文坛)
★
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本帖内容被屏蔽
3楼2016-03-03 21:50:33
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小猪9383

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问楼主iTraq标记的具体细节步骤是什么 我标记了一次失败了 不知道问题在哪里

发自小木虫IOS客户端
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4楼2017-12-11 15:35:43
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