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18116196449

新虫 (初入文坛)

[交流] 关于iTRAQ蛋白质相对定量的一些疑问 已有3人参与

对于取同等量的蛋白样品进行每个通路的iTRAQ标记。再将标记样品等量的混合-分级之后,MS/MS的结果,如何去确定差异蛋白是否上调或者下调?一直不太明白该相对定量是个什么情况。倘若1样中总共含有ABCDE中蛋白,50g的蛋白中分别表达10g,2样中因为某种原因导致A蛋白分泌增加A15g其他都保持不变。按照去同等量蛋白标记的原理,计算出来的A蛋白上调应该不是1.5.不太清楚其中的相对定量是一个什么样的概念。有哪位大神能解心中疑惑。
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馒头爱生物

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
的确不是1.5,因为iTRAQ每个样本上样量一致,你这一个样本50g,一个样本55g,需要先做归一化处理,倍数应该是1.5/1.1
不知道这样讲你明白了吗?
2楼2015-11-18 16:07:31
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lys1906

禁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

3楼2016-03-03 21:50:33
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小猪9383

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问楼主iTraq标记的具体细节步骤是什么 我标记了一次失败了 不知道问题在哪里

发自小木虫IOS客户端
4楼2017-12-11 15:35:43
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