24小时热门版块排行榜    

查看: 2844  |  回复: 15

zs806750658

铜虫 (正式写手)


[交流] 如何绘制原子轨迹图 已有5人参与

请问附图中的原子轨迹图是如何绘制的(附图)。我是用LAMMPS运行的分子动力学模拟,然后dump输出目标原子在运算过程中的坐标,然后用excel或origin将原子的横纵坐标分别设为x和y轴后,只能做出散点图,不知如何做出这样的“轨迹图”。请给予指导。
如何绘制原子轨迹图
原子轨迹图.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-13 15:11:29
楼主问下,你这个LAMMPS 学起来怎么样,是用fortune编程的吗?

对我而言学起来有些困难,我是地质学出身,物理化学基础相对薄弱。如果有人带的话学起来会容易很多。我不清楚是不是fortune编程,不过需要编写代码
6楼2015-11-14 00:18:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
10楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-14 09:16:10
难道楼主是自学的啊?...

肯定不是的啦,跟别人学的
11楼2015-11-17 23:17:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
9楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-14 09:14:07
看来咱们是一家啊,我是学石油开发的,我编程基础较差,学这个有点费劲...

是啊,所以有人带的话会容易一些
12楼2015-11-17 23:18:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

issp-hao

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-13 15:11:29
楼主问下,你这个LAMMPS 学起来怎么样,是用fortune编程的吗?

lammps是c++编写的,开源软件包
15楼2015-11-18 10:28:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

李加伟

荣誉版主 (文坛精英)

不过凡人

优秀版主优秀版主

关注下
人生海海,在于内心
2楼2015-11-13 13:31:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiezhou5322

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主问下,你这个LAMMPS 学起来怎么样,是用fortune编程的吗?
每个人只能陪你走一段路程
3楼2015-11-13 15:11:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ouyangyulou

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你用vmd软件,就有轨迹图
创新、思路决定出路
4楼2015-11-13 19:17:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luftf

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
origin直接画线就可以了啊
5楼2015-11-13 23:31:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
4楼: Originally posted by ouyangyulou at 2015-11-13 19:17:17
你用vmd软件,就有轨迹图

是吗,请问VMD能统计出氢键的个数吗
7楼2015-11-14 00:21:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
5楼: Originally posted by luftf at 2015-11-13 23:31:09
origin直接画线就可以了啊

好的,我试试,谢谢了
8楼2015-11-14 00:21:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiezhou5322

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by zs806750658 at 2015-11-14 00:18:09
对我而言学起来有些困难,我是地质学出身,物理化学基础相对薄弱。如果有人带的话学起来会容易很多。我不清楚是不是fortune编程,不过需要编写代码...

看来咱们是一家啊,我是学石油开发的,我编程基础较差,学这个有点费劲
每个人只能陪你走一段路程
9楼2015-11-14 09:14:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiezhou5322

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by zs806750658 at 2015-11-14 00:18:09
对我而言学起来有些困难,我是地质学出身,物理化学基础相对薄弱。如果有人带的话学起来会容易很多。我不清楚是不是fortune编程,不过需要编写代码...

难道楼主是自学的啊?
每个人只能陪你走一段路程
10楼2015-11-14 09:16:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zs806750658 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +4 archvillain 2026-08-15 7/350 2026-08-15 11:44 by archvillain
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-15 11:41 by KxMI1BYBxWX1
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 HFw0lei2R37i 2026-08-14 9/450 2026-08-15 11:33 by KxMI1BYBxWX1
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 04:45 by 4wMiSEwB6436
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 4/200 2026-08-15 04:17 by 4wMiSEwB6436
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 02:21 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +11 Tide man 2026-08-10 12/600 2026-08-15 02:12 by home3163
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 01:28 by 4wMiSEwB6436
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 7/350 2026-08-15 00:40 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[硕博家园] 一作与独作在应聘高校教师时区别大吗 +3 mbygzh 2026-08-08 4/200 2026-08-13 19:31 by 龙-樱
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
信息提示
请填处理意见