24小时热门版块排行榜    

查看: 2942  |  回复: 15

zs806750658

铜虫 (正式写手)


[交流] 如何绘制原子轨迹图 已有5人参与

请问附图中的原子轨迹图是如何绘制的(附图)。我是用LAMMPS运行的分子动力学模拟,然后dump输出目标原子在运算过程中的坐标,然后用excel或origin将原子的横纵坐标分别设为x和y轴后,只能做出散点图,不知如何做出这样的“轨迹图”。请给予指导。
如何绘制原子轨迹图
原子轨迹图.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-13 15:11:29
楼主问下,你这个LAMMPS 学起来怎么样,是用fortune编程的吗?

对我而言学起来有些困难,我是地质学出身,物理化学基础相对薄弱。如果有人带的话学起来会容易很多。我不清楚是不是fortune编程,不过需要编写代码
6楼2015-11-14 00:18:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
10楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-14 09:16:10
难道楼主是自学的啊?...

肯定不是的啦,跟别人学的
11楼2015-11-17 23:17:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
9楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-14 09:14:07
看来咱们是一家啊,我是学石油开发的,我编程基础较差,学这个有点费劲...

是啊,所以有人带的话会容易一些
12楼2015-11-17 23:18:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

issp-hao

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-13 15:11:29
楼主问下,你这个LAMMPS 学起来怎么样,是用fortune编程的吗?

lammps是c++编写的,开源软件包
15楼2015-11-18 10:28:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

李加伟

荣誉版主 (文坛精英)

不过凡人

优秀版主优秀版主

关注下
人生海海,在于内心
2楼2015-11-13 13:31:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiezhou5322

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主问下,你这个LAMMPS 学起来怎么样,是用fortune编程的吗?
每个人只能陪你走一段路程
3楼2015-11-13 15:11:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ouyangyulou

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你用vmd软件,就有轨迹图
创新、思路决定出路
4楼2015-11-13 19:17:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luftf

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
origin直接画线就可以了啊
5楼2015-11-13 23:31:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
4楼: Originally posted by ouyangyulou at 2015-11-13 19:17:17
你用vmd软件,就有轨迹图

是吗,请问VMD能统计出氢键的个数吗
7楼2015-11-14 00:21:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
5楼: Originally posted by luftf at 2015-11-13 23:31:09
origin直接画线就可以了啊

好的,我试试,谢谢了
8楼2015-11-14 00:21:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiezhou5322

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by zs806750658 at 2015-11-14 00:18:09
对我而言学起来有些困难,我是地质学出身,物理化学基础相对薄弱。如果有人带的话学起来会容易很多。我不清楚是不是fortune编程,不过需要编写代码...

看来咱们是一家啊,我是学石油开发的,我编程基础较差,学这个有点费劲
每个人只能陪你走一段路程
9楼2015-11-14 09:14:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiezhou5322

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by zs806750658 at 2015-11-14 00:18:09
对我而言学起来有些困难,我是地质学出身,物理化学基础相对薄弱。如果有人带的话学起来会容易很多。我不清楚是不是fortune编程,不过需要编写代码...

难道楼主是自学的啊?
每个人只能陪你走一段路程
10楼2015-11-14 09:16:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zs806750658 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:39 by 9i7PCSZyMzot
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:27 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:15 by 9i7PCSZyMzot
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:15 by 9i7PCSZyMzot
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:51 by 9i7PCSZyMzot
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:15 by 9i7PCSZyMzot
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:03 by 9i7PCSZyMzot
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-20 00:03 by 9i7PCSZyMzot
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:51 by 9i7PCSZyMzot
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:39 by 9i7PCSZyMzot
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:27 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:03 by 9i7PCSZyMzot
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:03 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-18 7/350 2026-09-19 21:03 by 9i7PCSZyMzot
[教师之家] 现代”学阀”该如何界定 +3 iaeyuan 2026-09-19 3/150 2026-09-19 20:52 by 没昵称呀
[基金申请] 国社科系统bug了,是不是要放榜了? +7 kynobel 2026-09-16 9/450 2026-09-19 14:52 by 接好运婷
[考博] 申博发邮件 +8 Lmengk 2026-09-15 9/450 2026-09-19 09:27 by 中间体超市
[有机交流] 各位大神,目前国内有哪些比较好用的逆合成软件? 20+3 zapen 2026-09-15 9/450 2026-09-18 18:17 by zapen
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组|2027级博士研究生招生公告 +7 水士口 2026-09-16 8/400 2026-09-16 13:47 by kkklens
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生 +8 两三岁ss 2026-09-14 8/400 2026-09-16 09:46 by 水士口
信息提示
请填处理意见