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汕头大学海洋科学接受调剂
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zs806750658

铜虫 (正式写手)


[交流] 如何绘制原子轨迹图 已有5人参与

请问附图中的原子轨迹图是如何绘制的(附图)。我是用LAMMPS运行的分子动力学模拟,然后dump输出目标原子在运算过程中的坐标,然后用excel或origin将原子的横纵坐标分别设为x和y轴后,只能做出散点图,不知如何做出这样的“轨迹图”。请给予指导。
如何绘制原子轨迹图
原子轨迹图.jpg
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zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-13 15:11:29
楼主问下,你这个LAMMPS 学起来怎么样,是用fortune编程的吗?

对我而言学起来有些困难,我是地质学出身,物理化学基础相对薄弱。如果有人带的话学起来会容易很多。我不清楚是不是fortune编程,不过需要编写代码
6楼2015-11-14 00:18:09
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zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
10楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-14 09:16:10
难道楼主是自学的啊?...

肯定不是的啦,跟别人学的
11楼2015-11-17 23:17:23
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zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
9楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-14 09:14:07
看来咱们是一家啊,我是学石油开发的,我编程基础较差,学这个有点费劲...

是啊,所以有人带的话会容易一些
12楼2015-11-17 23:18:06
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issp-hao

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-13 15:11:29
楼主问下,你这个LAMMPS 学起来怎么样,是用fortune编程的吗?

lammps是c++编写的,开源软件包
15楼2015-11-18 10:28:15
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普通回帖

李加伟

荣誉版主 (文坛精英)

不过凡人

优秀版主优秀版主

关注下
人生海海,在于内心
2楼2015-11-13 13:31:48
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jiezhou5322

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主问下,你这个LAMMPS 学起来怎么样,是用fortune编程的吗?
每个人只能陪你走一段路程
3楼2015-11-13 15:11:29
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ouyangyulou

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你用vmd软件,就有轨迹图
创新、思路决定出路
4楼2015-11-13 19:17:17
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luftf

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
origin直接画线就可以了啊
5楼2015-11-13 23:31:09
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zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
4楼: Originally posted by ouyangyulou at 2015-11-13 19:17:17
你用vmd软件,就有轨迹图

是吗,请问VMD能统计出氢键的个数吗
7楼2015-11-14 00:21:33
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zs806750658

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
5楼: Originally posted by luftf at 2015-11-13 23:31:09
origin直接画线就可以了啊

好的,我试试,谢谢了
8楼2015-11-14 00:21:55
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jiezhou5322

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by zs806750658 at 2015-11-14 00:18:09
对我而言学起来有些困难,我是地质学出身,物理化学基础相对薄弱。如果有人带的话学起来会容易很多。我不清楚是不是fortune编程,不过需要编写代码...

看来咱们是一家啊,我是学石油开发的,我编程基础较差,学这个有点费劲
每个人只能陪你走一段路程
9楼2015-11-14 09:14:07
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jiezhou5322

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by zs806750658 at 2015-11-14 00:18:09
对我而言学起来有些困难,我是地质学出身,物理化学基础相对薄弱。如果有人带的话学起来会容易很多。我不清楚是不是fortune编程,不过需要编写代码...

难道楼主是自学的啊?
每个人只能陪你走一段路程
10楼2015-11-14 09:16:10
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