应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 学妹求助
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 801  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

hshhqu3

新虫 (小有名气)

[交流] 学妹求助

请各位学长学姐，老师，专家等指点一下。非常感谢啊
1.NCBI基因组序列提交时，能提交包含 scaffolds 的序列文件吗？
测序公司给的基因组测序结果文件里（fna格式），含有几十个contigs 和十几个scaffolds.文件较大，我自己无法把contigs和 scaffolds分开。所以，提交序列时，能将contigs 和 scaffolds 一并提交吗？
2.能用什么方法来判定contigs里面有多少个chromosomes 和几个plasmids？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2015-11-10 14:58:34
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsy12

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by hshhqu3 at 2015-11-13 09:43:50
我传个文件给你看看哈。一个文件里不但有很多contigs，还有很多scaffolds. 怎么分离开啊。求指点啊。能将所有的contig是 序列提取出来吗？文件有几千页，手工是没法提取出contigs 序列的。
谢谢...

我看了你的文件，这个分开很容易，编个简单程序就可以了。你是生信的？
赞一下 回复此楼
4楼2015-11-13 11:07:19
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

lsy12

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
contigs和 scaffolds可以分开吧，把你的文件打开截个图看看
赞一下 回复此楼
2楼2015-11-12 19:00:35
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hshhqu3

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lsy12 at 2015-11-12 19:00:35
contigs和 scaffolds可以分开吧，把你的文件打开截个图看看

我传个文件给你看看哈。一个文件里不但有很多contigs，还有很多scaffolds. 怎么分离开啊。求指点啊。能将所有的contig是 序列提取出来吗？文件有几千页，手工是没法提取出contigs 序列的。
谢谢
赞一下 回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 80715.fna
    • 2015-11-13 09:43:48, 5.61 M
3楼2015-11-13 09:43:50
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hshhqu3

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lsy12 at 2015-11-13 11:07:19
我看了你的文件，这个分开很容易，编个简单程序就可以了。你是生信的？...

不会编程呢。
perl 语言啊什么的不会哦。
刚接触生物信息。
本科不是学这方面的。读研跨专业了。所以，真心不懂啊。心爽。。
赞一下 回复此楼
5楼2015-11-13 20:43:07
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿郑大085600，310分求调剂 +3 李潇可 2026-03-26 3/150 2026-03-27 03:39 by wxiongid
[考研] 324求调剂 +4 wysyjs25 2026-03-21 4/200 2026-03-26 20:38 by fmesaito
[考研] 312求调剂 +8 上岸吧ZJY 2026-03-22 12/600 2026-03-26 18:49 by muchong357
[考研] 085602化学工程求调剂。 +4 平乐乐乐 2026-03-26 4/200 2026-03-26 17:57 by fmesaito
[考研] 263求调剂 +6 yqdszhdap－ 2026-03-22 10/500 2026-03-26 13:11 by 公瑾逍遥
[考研] 调剂310 +3 温柔的晚安 2026-03-25 4/200 2026-03-25 23:16 by peike
[考研] 一志愿上海交大生物与医药专硕324分，求调剂 +6 jiajunX 2026-03-22 6/300 2026-03-25 23:05 by licg0208
[考研] 一志愿哈工大，085400，320，求调剂 +4 gdlf9999 2026-03-24 4/200 2026-03-25 23:01 by boxking200
[考研] 一志愿南航 335分 | 0856材料化工 | GPA 4.07 | 有科研经历 +6 cccchenso 2026-03-23 6/300 2026-03-25 22:25 by 544594351
[考研] 生物技术与工程 +3 1294608413 2026-03-25 4/200 2026-03-25 18:02 by 1294608413
[考研] 340求调剂 +5 话梅糖111 2026-03-24 5/250 2026-03-25 06:53 by ilovexiaobin
[考研] 一志愿北化315 求调剂 +3 akrrain 2026-03-24 3/150 2026-03-24 19:35 by 了了了了。。
[考研] 材料292调剂 +8 橘颂思美人 2026-03-23 8/400 2026-03-24 16:33 by laoshidan
[考博] 26申博自荐 +3 whh869393 2026-03-24 3/150 2026-03-24 09:55 by 21018060
[考研] 一志愿070300浙大化学358分，求调剂！ +4 酥酥鱼.. 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:12 by Iveryant
[考研] 319求调剂 +4 小力气珂珂 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:53 by ColorlessPI
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 336求调剂 +5 rmc8866 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:24 by 学员8dgXkO
[考研] 330求调剂0854 +3 assdll 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:01 by 搏击518
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭