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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 微生物多样性分析
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咯咯哒1993

新虫 (初入文坛)

[求助] 微生物多样性分析 已有4人参与

请问各位，我要做微生物多样性分析。是全基因组测序好呢还是高通量测序好？   高通量测序的话是要P出16s可变区吗？

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1楼 2015-11-08 20:01:15
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美亿美生物

捐助贵宾 (职业作家)

技术服务-实验代做

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果是研究多样性的话，采用高通量测序16s区域即可，但严格来说不好判断2个技术哪个更好研究多样性，很多客户进行选择价格是一个重要参考依据。全基因组出来的数据量大，价格也相应的高。具体有什么问题，你再问，或者搜索下，会有很多介绍

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2楼2015-11-09 10:19:47
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star013

新虫 (知名作家)
现在都是高通量测序，我们现在促销团购价550一个样本，还免费送一个样

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3楼2015-11-09 12:46:24
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biolinker

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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你说的这两种其实都应算是高通量测序做的，只是一个是宏基组方向，一个是做的靶基因序列。这两个方向有各自的优势。宏基因组测序在目前看来还是比较贵的。建议你还是做靶基因方向会好一些。便宜一点。
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4楼2015-11-09 13:53:44
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happy6

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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如果楼主只是关注微生物的多样性，菌群丰度，群落结构等，16S的高通量测序即可，对16S基因序列的某一可变区进行高通量测序。如果是关心样本中的微生物群体的基因组成及功能，探索微生物与环境及宿主之间的关系，发掘和研究新的具有特定功能的基因的话，可以考虑宏基因组测序。
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5楼2015-11-10 12:46:24
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KOP利

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

看你的研究目的和方向来决定用什么方法。只研究菌群多样性的话就16s，如果研究菌群基因组成和功能，那就所宏基因组测序。16S便宜，宏基因组贵。言简意赅，希望能帮到你
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YNWA！
6楼2015-11-30 13:56:34
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