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咯咯哒1993

新虫 (初入文坛)

[求助] 微生物多样性分析 已有4人参与

请问各位,我要做微生物多样性分析。是全基因组测序好呢还是高通量测序好?   高通量测序的话是要P出16s可变区吗?

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美亿美生物

捐助贵宾 (职业作家)

技术服务-实验代做


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果是研究多样性的话,采用高通量测序16s区域即可,但严格来说不好判断2个技术哪个更好研究多样性,很多客户进行选择价格是一个重要参考依据。全基因组出来的数据量大,价格也相应的高。具体有什么问题,你再问,或者搜索下,会有很多介绍

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2楼2015-11-09 10:19:47
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star013

新虫 (知名作家)


现在都是高通量测序,我们现在促销团购价550一个样本,还免费送一个样

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3楼2015-11-09 12:46:24
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biolinker

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你说的这两种其实都应算是高通量测序做的,只是一个是宏基组方向,一个是做的靶基因序列。这两个方向有各自的优势。宏基因组测序在目前看来还是比较贵的。建议你还是做靶基因方向会好一些。便宜一点。
4楼2015-11-09 13:53:44
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happy6

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果楼主只是关注微生物的多样性,菌群丰度,群落结构等,16S的高通量测序即可,对16S基因序列的某一可变区进行高通量测序。如果是关心样本中的微生物群体的基因组成及功能,探索微生物与环境及宿主之间的关系,发掘和研究新的具有特定功能的基因的话,可以考虑宏基因组测序。
5楼2015-11-10 12:46:24
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KOP利

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

看你的研究目的和方向来决定用什么方法。只研究菌群多样性的话就16s,如果研究菌群基因组成和功能,那就所宏基因组测序。16S便宜,宏基因组贵。言简意赅,希望能帮到你
YNWA!
6楼2015-11-30 13:56:34
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