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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » TA克隆请教
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低调5238

铜虫 (小有名气)

[求助] TA克隆请教

一个木头样品，检测其中的细菌和真菌成分，提完DNA后，用341f–907r扩增16S rDNA，用ITS1-ITS4扩增ITS，然后转化大肠，最后测序。但是测序结果blast以后好多都不对是怎么回事啊，之前做菌落PCR的时候都检测到有目的条带的。。

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1楼 2015-11-05 20:18:25
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大brain

银虫 (小有名气)
blast不对？没有比对到目标菌株？测的是木头里的真菌和细菌，你怎么能肯定比对到哪个菌？会不会是比对时没有将T载体或测序载体的序列去掉。blast时要注意先将载体序列去掉

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态度很重要
2楼2015-11-05 22:50:27
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