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R-3晶体数据坐标的转换问题
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aliceyang
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R-3晶体数据坐标的转换问题
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两个同构的R-3的晶体,一套晶体数据中两个重原子坐标为(1/3,2/3, 1/6), (2/3, 1/3, 1/2), 而另一套晶体数据中这两个原子坐标为(1/3,2/3, 1/6), (1/3, 2/3, 1/2),请教如何将两套坐标统一?
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2015-11-05 17:01:25
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aliceyang
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2楼
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Originally posted by
jackdeng
at 2015-11-06 09:00:16
为什么一定要统一呢?同构化合物也不一定要求坐标都得一样啊。
谢谢,已经通过grow找到了同坐标的特殊位置的重原子,再寻找其他原子。从你的回复得到了启发,谢谢!
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3楼
2015-11-06 13:59:36
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aliceyang: 金币+2
2015-11-06 12:45:40
为什么一定要统一呢?同构化合物也不一定要求坐标都得一样啊。
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2楼
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3楼
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aliceyang
at 2015-11-06 13:59:36
谢谢,已经通过grow找到了同坐标的特殊位置的重原子,再寻找其他原子。从你的回复得到了启发,谢谢!...
其他原子的坐标不一致,虽然同构,但是不同金属原子对原子的坐标影响还是比较大的,所以只有将两个特殊位置的原子坐标定成一致的了。
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4楼
2015-11-06 14:05:57
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3楼
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Originally posted by
aliceyang
at 2015-11-06 13:59:36
谢谢,已经通过grow找到了同坐标的特殊位置的重原子,再寻找其他原子。从你的回复得到了启发,谢谢!...
既然已经找到,你就可以通过envir和sgen命令找到其他的对称性相关的原子了
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5楼
2015-11-06 14:28:42
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